Missing coverage evidence...
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CTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCAACATT  >  minE/2168811‑2168880 |                                                                      cTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAgg                >  1:156671/1‑56 (MQ=255) cTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCaa      >  1:168067/1‑66 (MQ=255) cTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCAACAtt  >  1:15269/1‑70 (MQ=255) cTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCAACAtt  >  1:95029/1‑70 (MQ=255) cTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCAACAtt  >  1:619704/1‑70 (MQ=255) cTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCAACAtt  >  1:617427/1‑70 (MQ=255) cTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCAACAtt  >  1:546944/1‑70 (MQ=255) cTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCAACAtt  >  1:475372/1‑70 (MQ=255) cTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCAACAtt  >  1:474630/1‑70 (MQ=255) cTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCAACAtt  >  1:462198/1‑70 (MQ=255) cTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCAACAtt  >  1:430622/1‑70 (MQ=255) cTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCAACAtt  >  1:421638/1‑70 (MQ=255) cTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCAACAtt  >  1:359725/1‑70 (MQ=255) cTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCAACAtt  >  1:344797/1‑70 (MQ=255) cTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCAACAtt  >  1:334386/1‑70 (MQ=255) cTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCAACAtt  >  1:313871/1‑70 (MQ=255) cTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCAACAtt  >  1:272712/1‑70 (MQ=255) cTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCAACAtt  >  1:238439/1‑70 (MQ=255) cTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCAACAtt  >  1:217593/1‑70 (MQ=255) cTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCAACAtt  >  1:200713/1‑70 (MQ=255) cTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCAACAtt  >  1:157406/1‑70 (MQ=255) cTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCAACAtt  >  1:124518/1‑70 (MQ=255) cTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCAACAt   >  1:34653/1‑69 (MQ=255) cTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCAACAt   >  1:350785/1‑69 (MQ=255) cTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCAACAt   >  1:277065/1‑69 (MQ=255) cTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCAACAt   >  1:535812/1‑69 (MQ=255) cTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCAACAt   >  1:602236/1‑69 (MQ=255) cTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCAACAt   >  1:610986/1‑69 (MQ=255) |                                                                      CTACGAACTGGCAAAAGATTTTGTCGTTCTGACGGGTAATGCTTATCTGCAGCAGGTCGATAGCAACATT  >  minE/2168811‑2168880

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑