Missing coverage evidence...
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CTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATGG  >  minE/2171803‑2171873 |                                                                       cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGATGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:194408/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:557897/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:429267/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:457185/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:458316/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:48195/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:488131/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:493674/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:502794/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:504618/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:504659/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:51298/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:538263/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:416933/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:558031/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:571388/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:587826/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:630230/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:644390/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:656303/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:77226/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:88595/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:98464/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:294227/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:108207/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:112714/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:127536/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:15217/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:169717/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:171175/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:175236/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:20900/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:248936/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:288166/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:420671/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:295650/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:310785/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:317176/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:321608/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:349878/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:358054/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:372927/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:382468/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:41026/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATgg  <  1:105363/71‑1 (MQ=255) |                                                                       CTGCCGCCTCAGGTGGTTTTTGAAGCTATCCTGACGCGGGAAAAAATGGGCAGTACCGGTATCGGCAATGG  >  minE/2171803‑2171873

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑