Missing coverage evidence...
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CTGGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTCAC  >  minE/2220615‑2220684 |                                                                      ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:566400/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:40977/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:425702/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:482968/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:50332/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:505998/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:513604/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:52135/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:56433/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:395167/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:568851/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:582428/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:584999/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:602026/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:616391/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:70377/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:80331/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:89322/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:202350/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:113726/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:17208/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:173340/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:174379/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:17539/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:179041/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:185579/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:200802/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:100548/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:231438/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:244566/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:263216/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:283917/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:292381/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:366280/70‑1 (MQ=255) ctgGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTcac  <  1:390592/70‑1 (MQ=255) |                                                                      CTGGAATTTATCGCTATGCATACAGCTGTCGGGGCATACGCTTTACAGACGGCGGTGAAACGCCTGTCAC  >  minE/2220615‑2220684

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑