Missing coverage evidence...
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TGGTTAGTAGCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTTTTACCGGCTTTCCGCGCTGGTTTGAGATGGC  >  minE/2222732‑2222802 |                                                                       tGGTTAGTGGCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTTTTACCGGCTTTCCGCGCTGGTTTGAGATGGc  >  1:357354/1‑71 (MQ=255) tGGTTAGTATCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTTTTACCGGCTTTCCGCGCTGGTTTGAGATGGc  >  1:159343/1‑71 (MQ=255) tGGTTAGTAGCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTTTTACCGGCTTTCCGCGCTGGTTTGAGATgg   >  1:177284/1‑70 (MQ=255) tGGTTAGTAGCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTTTTACCGGCTTTCCGCGCTGGTTTGAGATgg   >  1:187661/1‑70 (MQ=255) tGGTTAGTAGCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTTTTACCGGCTTTCCGCGCTGGTTTGAGATGGc  >  1:315171/1‑71 (MQ=255) tGGTTAGTAGCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTTTTACCGGCTTTCCGCGCTGGTTTGAGATGGc  >  1:658631/1‑71 (MQ=255) tGGTTAGTAGCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTTTTACCGGCTTTCCGCGCTGGTTTGAGATGGc  >  1:612626/1‑71 (MQ=255) tGGTTAGTAGCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTTTTACCGGCTTTCCGCGCTGGTTTGAGATGGc  >  1:596672/1‑71 (MQ=255) tGGTTAGTAGCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTTTTACCGGCTTTCCGCGCTGGTTTGAGATGGc  >  1:581202/1‑71 (MQ=255) tGGTTAGTAGCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTTTTACCGGCTTTCCGCGCTGGTTTGAGATGGc  >  1:453626/1‑71 (MQ=255) tGGTTAGTAGCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTTTTACCGGCTTTCCGCGCTGGTTTGAGATGGc  >  1:451831/1‑71 (MQ=255) tGGTTAGTAGCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTTTTACCGGCTTTCCGCGCTGGTTTGAGATGGc  >  1:395176/1‑71 (MQ=255) tGGTTAGTAGCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTTTTACCGGCTTTCCGCGCTGGTTTGAGATGGc  >  1:36497/1‑71 (MQ=255) tGGTTAGTAGCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTTTTACCGGCTTTCCGCGCTGGTTTGAGATGGc  >  1:342148/1‑71 (MQ=255) tGGTTAGTAGCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTTTTACCGGCTTTCCGCGCTGGTTTGAGATGGc  >  1:322541/1‑71 (MQ=255) tGGTTAGTAGCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTTTTACCGGCTTTCCGCGCTGGTTTGAGATGGc  >  1:107248/1‑71 (MQ=255) tGGTTAGTAGCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTTTTACCGGCTTTCCGCGCTGGTTTGAGATGGc  >  1:310337/1‑71 (MQ=255) tGGTTAGTAGCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTTTTACCGGCTTTCCGCGCTGGTTTGAGATGGc  >  1:303667/1‑71 (MQ=255) tGGTTAGTAGCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTTTTACCGGCTTTCCGCGCTGGTTTGAGATGGc  >  1:287821/1‑71 (MQ=255) tGGTTAGTAGCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTTTTACCGGCTTTCCGCGCTGGTTTGAGATGGc  >  1:287802/1‑71 (MQ=255) tGGTTAGTAGCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTTTTACCGGCTTTCCGCGCTGGTTTGAGATGGc  >  1:272376/1‑71 (MQ=255) tGGTTAGTAGCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTTTTACCGGCTTTCCGCGCTGGTTTGAGATGGc  >  1:234964/1‑71 (MQ=255) tGGTTAGTAGCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTTTTACCGGCTTTCCGCGCTGGTTTGAGATGGc  >  1:168929/1‑71 (MQ=255) tGGTTAGTAGCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTTTTACCGGCTTTCCGCGCTGGTTTGAGATGGc  >  1:142453/1‑71 (MQ=255) tGGTTAGTAGCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTTTTACCGGCTTTCCGCGCTGGCTTGAGATGGc  >  1:426353/1‑71 (MQ=255) tGGTTAGTAGCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTTTTACCGGCTTTACGCGCTGGTTTGAGATGGc  >  1:47059/1‑71 (MQ=255) tGGTTAGTAGCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTATTACCGGCTTTCCgcgc                >  1:277709/1‑57 (MQ=255) |                                                                       TGGTTAGTAGCCGCTTACTTATCTGGCGTTGCCCCCGGTTTTACCGGCTTTCCGCGCTGGTTTGAGATGGC  >  minE/2222732‑2222802

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑