Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2240031	2240115	85	4 [0]	[0] 39	zraS	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with ZraR

AGAGCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAC  >  minE/2240116‑2240186 |                                                                       agagagCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGccc                       >  1:585260/1‑50 (MQ=255) agagagCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:119807/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGc      >  1:279178/1‑67 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:583877/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:442937/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:443592/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:4553/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:465104/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:470822/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:472331/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:517480/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:530657/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:535509/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:387987/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:595753/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:599704/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:605756/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:615240/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:621406/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:660255/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:78175/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:223567/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:110516/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:15472/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:157977/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:186943/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:188463/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:196163/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:200185/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:223515/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:399717/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:223824/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:248927/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:282030/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:292171/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:292814/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:293213/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:33387/1‑71 (MQ=255) agagCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAc  >  1:109780/1‑71 (MQ=255) |                                                                       AGAGCGCACGCCCGACCTTATCGGGGTCGCTATGAAGAATAATGATGCCCTGCGCATCGGTGACTGCGAAC  >  minE/2240116‑2240186

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑