Missing coverage evidence...
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CCATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGC  >  minE/2240506‑2240576 |                                                                       ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:514158/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:99390/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:86769/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:82837/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:79374/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:623237/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:623230/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:621961/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:615558/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:609407/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:589553/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:580324/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:551582/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:540965/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:111106/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:509386/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:508630/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:501029/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:478327/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:403037/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:364364/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:341107/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:300266/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:199330/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:162304/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:146393/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:121929/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGT‑AAAATGACTCGc  <  1:254811/70‑1 (MQ=255) |                                                                       CCATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGC  >  minE/2240506‑2240576

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑