Missing coverage evidence...
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AAGATTCGACGGGTAGCTATCATGCTTATCGCCAAGACCAACCAATGACAGCAATTCCGTCACGCGACGTT  >  minE/201048‑201118 |                                                                       aaGATTCGACGGGTAGCTATCATGCTTATCGCCaa                                      >  1:571636/1‑35 (MQ=255) aaGATTCGACGGGTAGCTATCATGCTTATCGCCAAGa                                    >  1:165189/1‑37 (MQ=255) aaGATTCGACGGGTAGCTATCATGCTTATCGCCAAGa                                    >  1:401598/1‑37 (MQ=255) aaGATTCGACGGGTAGCTATCATGCTTATCGCCAAGACCAACCAATGATAGCAATACCGTCACGCGCCGtt  >  1:488403/1‑71 (MQ=255) aaGATTCGACGGGTAGCTATCATGCTTATCGCCAAGACCAACCAATGACAGCAATTCCGTCACGCGACGtt  >  1:254359/1‑71 (MQ=255) aaGATTCGACGGGTAGCTATCATGCTTATCGCCAAGACCAACCAATGACAGCAATTCCGTCACGCGACGtt  >  1:370706/1‑71 (MQ=255) aaGATTCGACGGGTAGCTATCATGCTTATCGCCAAGACCAACCAATGACAGCAATTCCGTCACGCGACGtt  >  1:408623/1‑71 (MQ=255) aaGATTCGACGGGTAGCTATCATGCTTATCGCCAAGACCAACCAATGACAGCAATTCCGTCACGCGACGtt  >  1:414605/1‑71 (MQ=255) aaGATTCGACGGGTAGCTATCATGCTTATCGCCAAGACCAACCAATGACAGCAATTCCGTCACGCGACGtt  >  1:495575/1‑71 (MQ=255) aaGATTCGACGGGTAGCTATCATGCTTATCGCCAAGACCAACCAATGACAGCAATTCCGTCACGCGACGtt  >  1:497480/1‑71 (MQ=255) aaGATTCGACGGGTAGCTATCATGCTTATCGCCAAGACCAACCAATGACAGCAATTCCGTCACGCGACGtt  >  1:529602/1‑71 (MQ=255) aaGATTCGACGGGTAGCTATCATGCTTATCGCCAAGACCAACCAATGACAGCAATTCCGTCACGCGACGtt  >  1:608935/1‑71 (MQ=255) aaGATTCGACGGGTAGCTATCATGCTTATCGCCAAGACCAACCAATGACAGCAATTCCGTCACGCGACGtt  >  1:615034/1‑71 (MQ=255) aaGATTCGACGGGTAGCTATCATGCTTATCGCCAAGACCAACCAATGACAGCAATTCCGTCACGCGACGt   >  1:545016/1‑70 (MQ=255) aaGATTCGACGGGTAGCTATCATGCTTATCGCCAAGACCAACCAATGACAGCAATTCCGTCACGCGACGt   >  1:579923/1‑70 (MQ=255) aaGATTCGACGGGTAGCTATCATGCTTATCGCCAAGACCAACCAATGACAGCAATTCCGTCACGCGACGt   >  1:84180/1‑70 (MQ=255) |                                                                       AAGATTCGACGGGTAGCTATCATGCTTATCGCCAAGACCAACCAATGACAGCAATTCCGTCACGCGACGTT  >  minE/201048‑201118

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑