Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
RA minE 825,185 C→T 100% E32K (GAG→AAG)  ychN ← conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*minE825,1850CT100.0% 61.8 / NA 18E32K (GAG→AAG) ychNconserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/18);  total (0/18)
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold.
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand.

CTCTCCTGCTCTCGTAACGCAATGGCCAGCCGCAAGCTGTTAAACAAGGATTCGCTCCCGTAAGGTGCGC  >  minE/825181‑825250
    |                                                                 
ctctTCTGCTCTCGTAACGCAATGGCCAGCCGCAAGCTGTTAAACAAGGATTCGCTCCCGTAAGGTgcgc  <  1:359329/70‑1 (MQ=255)
ctctTCTGCTCTCGTAACGCAATGGCCAGCCGCAAGCTGTTAAACAAGGATTCGCTCCCGTAAGGTgcgc  <  1:70830/70‑1 (MQ=255)
ctctTCTGCTCTCGTAACGCAATGGCCAGCCGCAAGCTGTTAAACAAGGATTCGCTCCCGTAAGGTgcgc  <  1:651022/70‑1 (MQ=255)
ctctTCTGCTCTCGTAACGCAATGGCCAGCCGCAAGCTGTTAAACAAGGATTCGCTCCCGTAAGGTgcgc  <  1:630877/70‑1 (MQ=255)
ctctTCTGCTCTCGTAACGCAATGGCCAGCCGCAAGCTGTTAAACAAGGATTCGCTCCCGTAAGGTgcgc  <  1:550986/70‑1 (MQ=255)
ctctTCTGCTCTCGTAACGCAATGGCCAGCCGCAAGCTGTTAAACAAGGATTCGCTCCCGTAAGGTgcgc  <  1:545064/70‑1 (MQ=255)
ctctTCTGCTCTCGTAACGCAATGGCCAGCCGCAAGCTGTTAAACAAGGATTCGCTCCCGTAAGGTgcgc  <  1:475391/70‑1 (MQ=255)
ctctTCTGCTCTCGTAACGCAATGGCCAGCCGCAAGCTGTTAAACAAGGATTCGCTCCCGTAAGGTgcgc  <  1:470030/70‑1 (MQ=255)
ctctTCTGCTCTCGTAACGCAATGGCCAGCCGCAAGCTGTTAAACAAGGATTCGCTCCCGTAAGGTgcgc  <  1:455380/70‑1 (MQ=255)
ctctTCTGCTCTCGTAACGCAATGGCCAGCCGCAAGCTGTTAAACAAGGATTCGCTCCCGTAAGGTgcgc  <  1:36599/70‑1 (MQ=255)
ctctTCTGCTCTCGTAACGCAATGGCCAGCCGCAAGCTGTTAAACAAGGATTCGCTCCCGTAAGGTgcgc  <  1:175200/70‑1 (MQ=255)
ctctTCTGCTCTCGTAACGCAATGGCCAGCCGCAAGCTGTTAAACAAGGATTCGCTCCCGTAAGGTgcgc  <  1:346113/70‑1 (MQ=255)
ctctTCTGCTCTCGTAACGCAATGGCCAGCCGCAAGCTGTTAAACAAGGATTCGCTCCCGTAAGGTgcgc  <  1:338908/70‑1 (MQ=255)
ctctTCTGCTCTCGTAACGCAATGGCCAGCCGCAAGCTGTTAAACAAGGATTCGCTCCCGTAAGGTgcgc  <  1:324790/70‑1 (MQ=255)
ctctTCTGCTCTCGTAACGCAATGGCCAGCCGCAAGCTGTTAAACAAGGATTCGCTCCCGTAAGGTgcgc  <  1:313475/70‑1 (MQ=255)
ctctTCTGCTCTCGTAACGCAATGGCCAGCCGCAAGCTGTTAAACAAGGATTCGCTCCCGTAAGGTgcgc  <  1:294383/70‑1 (MQ=255)
ctctTCTGCTCTCGTAACGCAATGGCCAGCCGCAAGCTGTTAAACAAGGATTCGCTCCCGTAAGGTgcgc  <  1:253713/70‑1 (MQ=255)
ctctTCTGCTCTCGTAACGCAATGGCCAGCCGCAAGCTGTTAAACAAGGATTCGCTCCCGTAAGGTgcgc  <  1:208587/70‑1 (MQ=255)
 tcttctGCTCTCGTAACGCAATGGCCAGCCGCAAGCTGTTAAACAAGGATTCGCTCCCGTAAGGTgcgc  <  1:281150/69‑1 (MQ=255)
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CTCTCCTGCTCTCGTAACGCAATGGCCAGCCGCAAGCTGTTAAACAAGGATTCGCTCCCGTAAGGTGCGC  >  minE/825181‑825250

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: