Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	minE	2,753,930	A→T	100%	I24I (ATT→ATA)	mscL ←	mechanosensitive channel

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	minE	2,753,930	0	A	T	100.0%	146.7 / NA	40	I24I (ATT→ATA)	mscL	mechanosensitive channel
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base T (0/40);  total (0/40)
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold.
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand.

TCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATAATGACACCCACCGCCAAATCCACCAC  >  minE/2753886‑2753956                                             |                           tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:579481/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:407279/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:410818/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:417131/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:420990/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:434528/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:543418/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:55799/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:566799/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:575405/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:168618/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:581496/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:586375/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:599864/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:613714/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:635535/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:653649/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:71985/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:94233/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:3098/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:197325/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:203463/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:217127/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:228453/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:257772/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:264570/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:295071/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:303453/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:324818/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:325605/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:342772/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:185748/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:374865/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:156996/71‑1 (MQ=255) tCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:394301/71‑1 (MQ=255)  cGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:518049/70‑1 (MQ=255)   ggCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:96084/69‑1 (MQ=255)    gCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:351507/68‑1 (MQ=255)       aCCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:389516/65‑1 (MQ=255)                                aTGCCGCACCGATTATGACACCCACCGCCAAATCcaccac  <  1:411899/40‑1 (MQ=255)                                             |                           TCGGCAACCAGTGAAGAGACAATCTTCCCGAATGCCGCACCGATAATGACACCCACCGCCAAATCCACCAC  >  minE/2753886‑2753956

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑