Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1039313	1039328	16	7 [0]	[1] 2	nth	DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase

TGCGTGAGAACAATCCTCATCCCACCACCGAGCTTAATTTCAGTTCGCCTTTTGAATTGCTG  >  minE/1039251‑1039312                                                              | tGCGTGAGAACAATCCTCATCCCACCACCGAGCTTAATTTCAGTTCGCCTTTTGAATTGCTg  <  1:308634/62‑1 (MQ=255) tGCGTGAGAACAATCCTCATCCCACCACCGAGCTTAATTTCAGTTCGCCTTTTGAATTGCTg  <  1:498648/62‑1 (MQ=255) tGCGTGAGAACAATCCTCATCCCACCACCGAGCTTAATTTCAGTTCGCCTTTTGAATTGCTg  <  1:550808/62‑1 (MQ=255) tGCGTGAGAACAATCCTCATCCCACCACCGAGCTTAATTTCAGTTCGCCTTTTGAATTGCTg  <  1:95601/62‑1 (MQ=255)  gCGTGAGAACAATCCTCATCCCACCACCGAGCTTAATTTCAGTTCGCCTTTTGAATTGCTg  <  1:433115/61‑1 (MQ=255)  gCGTGAGAACAATCCTCATCCCACCACCGAGCTTAATTTCAGTTCGCCTTTTGAATTGCTg  <  1:538430/61‑1 (MQ=255)  gCGTGAGAACAATCCTCATCCCACCACCGAGCTTAATTTCAGTTCGCCTTTTCAATTGCTg  <  1:125092/61‑1 (MQ=255)                                                              | TGCGTGAGAACAATCCTCATCCCACCACCGAGCTTAATTTCAGTTCGCCTTTTGAATTGCTG  >  minE/1039251‑1039312

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑