Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1288060	1288100	41	2 [0]	[1] 2	shiA	shikimate transporter

GTCGGTTATCAGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTC  >  minE/1288100‑1288162  |                                                              gTCGGTTATCAGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACt   <  1:19511/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTATCAGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACtc  >  1:278584/1‑62 (MQ=255)  |                                                              GTCGGTTATCAGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTC  >  minE/1288100‑1288162

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑