Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | minE | 2,802,519 | T→A | D196V (GAT→GTT) | qor ← | quinone oxidoreductase, NADPH‑dependent |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | minE | 2,802,519 | 0 | T | A | 100.0% | 192.9 / NA | 62 | D196V (GAT→GTT) | qor | quinone oxidoreductase, NADPH‑dependent |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (54/8); total (54/8) |
TGCCCACGGAATCGTACACCACGCGCACTTTCTTACCGCCGGTGATCTCTTTTAACCGCTCGACCAGATCCTCTTCACGATAGTTAATAACCTGCCACGCGCCCGCTTTTAGCGCGCTCTGCGCTTTTTGCGCGG > minE/2802451‑2802585 | tGCCCACGGAATCGTACACCACGCGCACTTTCTTACCGCCGGTGATCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAAcc > 1:4170310/1‑71 (MQ=255) tGCCCACGGAATCGTACACCACGCGCACTTTCTTACCGCCGGTGATCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAAcc > 1:3803575/1‑71 (MQ=255) tGCCCACGGAATCGTACACCACGCGCACTTTCTTACCGCCGGTGATCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAAcc > 1:783793/1‑71 (MQ=255) gAATCGTACACCACGCGCACTTTCTTACCGCCGGTGATCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCAc > 1:2718193/1‑70 (MQ=255) gAATCGTACACCACGCGCACTTTCTTACCGCCGGTGATCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCAc > 1:809341/1‑70 (MQ=255) gAATCGTACACCACGCGCACTTTCTTACCGCCGGTGATCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCAc > 1:2773708/1‑70 (MQ=255) gAATCGTACACCACGCGCACTTTCTTACCGCCGGTGATCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCAc > 1:2986072/1‑70 (MQ=255) gAATCGTACACCACGCGCACTTTCTTACCGCCGGTGATCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCAc > 1:3052786/1‑70 (MQ=255) gAATCGTACACCACGCGCACTTTCTTACCGCCGGTGATCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCAc > 1:2124473/1‑70 (MQ=255) gAATCGTACACCACGCGCACTTTCTTACCGCCGGTGATCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCAc > 1:2055405/1‑70 (MQ=255) gAATCGTACACCACGCGCACTTTCTTACCGCCGGTGATCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCAc > 1:887565/1‑70 (MQ=255) gAATCGTACACCACGCGCACTTTCTTACCGCCGGTGATCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCAc > 1:3495448/1‑70 (MQ=255) gAATCGTACACCACGCGCACTTTCTTACCGCCGGTGATCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCAc > 1:143367/1‑70 (MQ=255) gAATCGTACACCACGCGCACTTTCTTACCGCCGGTGATCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCAc > 1:3763614/1‑70 (MQ=255) gAATCGTACACCACGCGCACTTTCTTACCGCCGGTGATCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCGTCAc > 1:3178109/1‑70 (MQ=255) ttCTTACCGCCGGTGATCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCa > 1:3761629/1‑48 (MQ=255) ttCTTACCGCCGGTGATCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTTAATAACCTGCCAcgc > 1:3347762/1‑71 (MQ=255) ttCTTACCGCCGGTGATCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTTAATAACCTGCCAcgc > 1:653250/1‑71 (MQ=255) ttCTTACCGCCGGTGATCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTTAATAACCTGCCAcgc > 1:922342/1‑71 (MQ=255) ttCTTACCGCCGGTGATCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTTAATAACCTGCCAcgc > 1:1633838/1‑71 (MQ=255) ttCTTACCGCCGGTGATCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTTAATAACCTGCCAcg > 1:3654512/1‑70 (MQ=255) ttCTTACCGCCGGTGATCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTTAATAACCTGCCAc > 1:107606/1‑69 (MQ=255) aTCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTtaat < 1:531537/44‑1 (MQ=255) aTCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTtaat < 1:2414326/44‑1 (MQ=255) aTCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTtaat < 1:2370265/44‑1 (MQ=255) aTCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTtaat < 1:1196282/44‑1 (MQ=255) aTCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTtaat < 1:2203270/44‑1 (MQ=255) aTCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTtaat < 1:2079504/44‑1 (MQ=255) aTCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTtaat < 1:3373481/44‑1 (MQ=255) aTCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTtaat < 1:3509255/44‑1 (MQ=255) aTCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTTAATAACCTGCCACGCGCCCGCTTTTAgcgc > 1:489503/1‑71 (MQ=255) aTCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTTAATAACCTGCCACGCGCCCGCTTTTAgcgc > 1:382990/1‑71 (MQ=255) aTCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTTAATAACCTGCCACGCGCCCGCTTTTAgcgc > 1:892612/1‑71 (MQ=255) aTCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTTAATAACCTGCCACGCGCCCGCTTTTAgcgc > 1:1449319/1‑71 (MQ=255) aTCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTTAATAACCTGCCACGCGCCCGCTTTTAgcgc > 1:3139261/1‑71 (MQ=255) aTCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTTAATAACCTGCCACGCGCCCGCTTTTAgcgc > 1:2249852/1‑71 (MQ=255) aTCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTTAATAACCTGCCACGCGCCCGCTTTTAgcgc > 1:2957698/1‑71 (MQ=255) aTCTCTTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTTAATAACCTGCCACGCGCCCGCTTTTAgcgc > 1:2440951/1‑71 (MQ=255) ctctTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTtaataa > 1:1791876/1‑44 (MQ=255) ctctTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTtaataa > 1:3458384/1‑44 (MQ=255) ctctTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTtaataa > 1:3095286/1‑44 (MQ=255) ctctTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTtaataa > 1:3799924/1‑44 (MQ=255) ctctTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTtaataa > 1:862804/1‑44 (MQ=255) ctctTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTtaataa > 1:3914047/1‑44 (MQ=255) ctctTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTtaataa > 1:649561/1‑44 (MQ=255) ctctTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTtaataa > 1:599798/1‑44 (MQ=255) ctctTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTtaataa > 1:4067183/1‑44 (MQ=255) ctctTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTtaataa > 1:2719209/1‑44 (MQ=255) ctctTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTtaata > 1:3400028/1‑43 (MQ=255) ctctTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTTAATAAcc > 1:560834/1‑46 (MQ=255) ctctTTTAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTTAATAACCTGCCACGCGCCCGCTTTTAgcgcgc > 1:3647457/1‑71 (MQ=255) ctctTTGAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTtaataa > 1:555732/1‑44 (MQ=38) ttAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTTAATAACCTGCCACGCGCCCGCTTTTAGCGCGCTCTgc > 1:483033/1‑71 (MQ=255) ttAACCGCTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTTAATAACCTGCCACGCGCCCGCTTTTAGCGCGCTCTgc > 1:4032900/1‑71 (MQ=255) cTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTTAATAACCTGCCACGCGCCCGCTTTTAGTGCGCTCTGCGCttttt > 1:4264287/1‑71 (MQ=255) cTCGACCAGAACCTCTTCACGATAGTTAATAACCTGCCACGCGCCCGCTTTTAGCGCGCTCTGCGCttttt > 1:1152693/1‑71 (MQ=255) cAGAACCTCTTCACGATAGTTAATAACCTGCCAcg > 1:1407698/1‑35 (MQ=255) cAGAACCTCTTCACGATAGTTAATAACCTGCCACGCGCCCGCTTTTAGCGCGCTCTGCGCTTTTTGCGCgg > 1:3999480/1‑71 (MQ=255) cAGAACCTCTTCACGATAGTTAATAACCTGCCACGCGCCCGCTTTTAGCGCGCTCTGCGCTTTTTGCGCgg > 1:3043076/1‑71 (MQ=255) cAGAACCTCTTCACGATAGTTAATAACCTGCCACGCGCCCGCTTTTAGCGCGCTCTGCGCTTTTTGCGCgg > 1:2724239/1‑71 (MQ=255) cAGAACCTCTTCACGATAGTTAATAACCTGCCACGCGCCCGCTTTTAGCGCGCTCTGCGCTTTTTGCGCgg > 1:2249974/1‑71 (MQ=255) cAGAACCTCTTCACGATAGTTAATAACCTGCCACGCGCCCGCTTTTAGCGCGCTCTGCGCTTTTTGCGCgg > 1:1916933/1‑71 (MQ=255) | TGCCCACGGAATCGTACACCACGCGCACTTTCTTACCGCCGGTGATCTCTTTTAACCGCTCGACCAGATCCTCTTCACGATAGTTAATAACCTGCCACGCGCCCGCTTTTAGCGCGCTCTGCGCTTTTTGCGCGG > minE/2802451‑2802585 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |