Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	minE	948,607	+C	coding (2230/2400 nt)	dos ←	cAMP phosphodiesterase, heme‑regulated

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	minE	948,604	1	.	C	100.0%	59.7 / NA	17	Q745E (CAA→GAA)	dos	cAMP phosphodiesterase, heme‑regulated
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base . (0/0);  new base C (17/0);  total (17/0)

TCAAATTGCTCTTTGGTTTCGACGCCTTCCGCCACGACGGTTAAATTGAGGCTTTG‑CCCAATGCTGGTAAT  >  minE/948549‑948619                                                         |                tcAAATTGCTCTTTGGTTTCGACGCCTTCCGCCACGACGGTTAAATTGAGGCTTTGCCCCAATGCTGGTaa   >  1:2979286/1‑71 (MQ=255) tcAAATTGCTCTTTGGTTTCGACGCCTTCCGCCACGACGGTTAAATTGAGGCTTTGCCCCAATGCTGGTaa   >  1:877012/1‑71 (MQ=255) tcAAATTGCTCTTTGGTTTCGACGCCTTCCGCCACGACGGTTAAATTGAGGCTTTGCCCCAATGCTGGTaa   >  1:652397/1‑71 (MQ=255) tcAAATTGCTCTTTGGTTTCGACGCCTTCCGCCACGACGGTTAAATTGAGGCTTTGCCCCAATGCTGGTaa   >  1:601084/1‑71 (MQ=255) tcAAATTGCTCTTTGGTTTCGACGCCTTCCGCCACGACGGTTAAATTGAGGCTTTGCCCCAATGCTGGTaa   >  1:488434/1‑71 (MQ=255) tcAAATTGCTCTTTGGTTTCGACGCCTTCCGCCACGACGGTTAAATTGAGGCTTTGCCCCAATGCTGGTaa   >  1:3172250/1‑71 (MQ=255) tcAAATTGCTCTTTGGTTTCGACGCCTTCCGCCACGACGGTTAAATTGAGGCTTTGCCCCAATGCTGGTaa   >  1:3159610/1‑71 (MQ=255) tcAAATTGCTCTTTGGTTTCGACGCCTTCCGCCACGACGGTTAAATTGAGGCTTTGCCCCAATGCTGGTaa   >  1:2985690/1‑71 (MQ=255) tcAAATTGCTCTTTGGTTTCGACGCCTTCCGCCACGACGGTTAAATTGAGGCTTTGCCCCAATGCTGGTaa   >  1:1366346/1‑71 (MQ=255) tcAAATTGCTCTTTGGTTTCGACGCCTTCCGCCACGACGGTTAAATTGAGGCTTTGCCCCAATGCTGGTaa   >  1:2547807/1‑71 (MQ=255) tcAAATTGCTCTTTGGTTTCGACGCCTTCCGCCACGACGGTTAAATTGAGGCTTTGCCCCAATGCTGGTaa   >  1:2162437/1‑71 (MQ=255) tcAAATTGCTCTTTGGTTTCGACGCCTTCCGCCACGACGGTTAAATTGAGGCTTTGCCCCAATGCTGGTaa   >  1:19618/1‑71 (MQ=255) tcAAATTGCTCTTTGGTTTCGACGCCTTCCGCCACGACGGTTAAATTGAGGCTTTGCCCCAATGCTGGTaa   >  1:1907054/1‑71 (MQ=255) tcAAATTGCTCTTTGGTTTCGACGCCTTCCGCCACGACGGTTAAATTGAGGCTTTGCCCCAATGCTGGTaa   >  1:183920/1‑71 (MQ=255) tcAAATTGCTCTTTGGTTTCGACGCCTTCCGCCACGACGGTTAAATTGAGGCTTTGCCCCAATGCTGGTaa   >  1:1595650/1‑71 (MQ=255) tcAAATTGCTCTTTGGTTTCGACGCCTTCCGCCACGACGGTTAAATTGAGGCTTTGCCCCAATGCTGGTaa   >  1:1574523/1‑71 (MQ=255) tcAAATT‑CTCTTTGGTTTCGACGCCTTCCGCCACGACGGTTAAATTGAGGCTTTGCCCCAATGCTGGTAAt  >  1:3061701/1‑71 (MQ=255)                                                         |                TCAAATTGCTCTTTGGTTTCGACGCCTTCCGCCACGACGGTTAAATTGAGGCTTTG‑CCCAATGCTGGTAAT  >  minE/948549‑948619

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑