Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1520523	1520536	14	19 [0]	[0] 4	truA	pseudouridylate synthase I

GTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTA  >  minE/1520465‑1520522                                                          | gTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTa  <  1:1561111/58‑1 (MQ=255) gTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTa  <  1:990853/58‑1 (MQ=255) gTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTa  <  1:548463/58‑1 (MQ=255) gTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTa  <  1:3662/58‑1 (MQ=255) gTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTa  <  1:3117050/58‑1 (MQ=255) gTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTa  <  1:3099976/58‑1 (MQ=255) gTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTa  <  1:2997638/58‑1 (MQ=255) gTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTa  <  1:2823396/58‑1 (MQ=255) gTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTa  <  1:2490627/58‑1 (MQ=255) gTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTa  <  1:2230122/58‑1 (MQ=255) gTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTa  <  1:1891194/58‑1 (MQ=255) gTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTa  <  1:1737308/58‑1 (MQ=255) gTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTa  <  1:1735865/58‑1 (MQ=255) gTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTa  <  1:1311248/58‑1 (MQ=255)  ttCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTa  <  1:2749309/57‑1 (MQ=255)  ttCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTa  <  1:2400238/57‑1 (MQ=255)  ttCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTa  <  1:3259913/57‑1 (MQ=255)  gtCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTa  <  1:914038/56‑1 (MQ=255)    cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTa  <  1:2112103/55‑1 (MQ=255)                                                          | GTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTA  >  minE/1520465‑1520522

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑