Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1532493	1532498	6	19 [0]	[0] 8	aroC	chorismate synthase

AAACGTCCTTAATCGCACTGTAATCCTGAGAGCGCTGGTCAGTGTTTTCGATCAACAAGCCAATGCTGGTG  >  minE/1532422‑1532492                                                                       | aaaCGTCCTTAATCGCACTGTAATCCTGAGAGCGCTGGTCAGTGTTTTCGATCAACAAGCCAATGCTGGTg  >  1:2930153/1‑71 (MQ=255) aaaCGTCCTTAATCGCACTGTAATCCTGAGAGCGCTGGTCAGTGTTTTCGATCAACAAGCCAATGCTGGTg  >  1:830749/1‑71 (MQ=255) aaaCGTCCTTAATCGCACTGTAATCCTGAGAGCGCTGGTCAGTGTTTTCGATCAACAAGCCAATGCTGGTg  >  1:68975/1‑71 (MQ=255) aaaCGTCCTTAATCGCACTGTAATCCTGAGAGCGCTGGTCAGTGTTTTCGATCAACAAGCCAATGCTGGTg  >  1:687476/1‑71 (MQ=255) aaaCGTCCTTAATCGCACTGTAATCCTGAGAGCGCTGGTCAGTGTTTTCGATCAACAAGCCAATGCTGGTg  >  1:621861/1‑71 (MQ=255) aaaCGTCCTTAATCGCACTGTAATCCTGAGAGCGCTGGTCAGTGTTTTCGATCAACAAGCCAATGCTGGTg  >  1:616090/1‑71 (MQ=255) aaaCGTCCTTAATCGCACTGTAATCCTGAGAGCGCTGGTCAGTGTTTTCGATCAACAAGCCAATGCTGGTg  >  1:607430/1‑71 (MQ=255) aaaCGTCCTTAATCGCACTGTAATCCTGAGAGCGCTGGTCAGTGTTTTCGATCAACAAGCCAATGCTGGTg  >  1:442562/1‑71 (MQ=255) aaaCGTCCTTAATCGCACTGTAATCCTGAGAGCGCTGGTCAGTGTTTTCGATCAACAAGCCAATGCTGGTg  >  1:3064822/1‑71 (MQ=255) aaaCGTCCTTAATCGCACTGTAATCCTGAGAGCGCTGGTCAGTGTTTTCGATCAACAAGCCAATGCTGGTg  >  1:300561/1‑71 (MQ=255) aaaCGTCCTTAATCGCACTGTAATCCTGAGAGCGCTGGTCAGTGTTTTCGATCAACAAGCCAATGCTGGTg  >  1:1039423/1‑71 (MQ=255) aaaCGTCCTTAATCGCACTGTAATCCTGAGAGCGCTGGTCAGTGTTTTCGATCAACAAGCCAATGCTGGTg  >  1:2476261/1‑71 (MQ=255) aaaCGTCCTTAATCGCACTGTAATCCTGAGAGCGCTGGTCAGTGTTTTCGATCAACAAGCCAATGCTGGTg  >  1:2215352/1‑71 (MQ=255) aaaCGTCCTTAATCGCACTGTAATCCTGAGAGCGCTGGTCAGTGTTTTCGATCAACAAGCCAATGCTGGTg  >  1:2074323/1‑71 (MQ=255) aaaCGTCCTTAATCGCACTGTAATCCTGAGAGCGCTGGTCAGTGTTTTCGATCAACAAGCCAATGCTGGTg  >  1:2036247/1‑71 (MQ=255) aaaCGTCCTTAATCGCACTGTAATCCTGAGAGCGCTGGTCAGTGTTTTCGATCAACAAGCCAATGCTGGTg  >  1:162794/1‑71 (MQ=255) aaaCGTCCTTAATCGCACTGTAATCCTGAGAGCGCTGGTCAGTGTTTTCGATCAACAAGCCAATGCTGGTg  >  1:1334160/1‑71 (MQ=255) aaaCGTCCTTAATCGCACTGTAATCCTGAGAGCGCTGGTCAGTGTTTTCGATCAACAAGCCAATGCTGGTg  >  1:1242675/1‑71 (MQ=255) aaaCGTCCTTAATCGCACTGTAATCCTGAGAGCGCTGGCCAGTGTTTTCGATCAACAAGCCAATGCTGGTg  >  1:2258271/1‑71 (MQ=255)                                                                       | AAACGTCCTTAATCGCACTGTAATCCTGAGAGCGCTGGTCAGTGTTTTCGATCAACAAGCCAATGCTGGTG  >  minE/1532422‑1532492

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑