Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1938622	1938625	4	13 [0]	[0] 13	xerD	site‑specific tyrosine recombinase

TACAACACTTCAAGCATGGCTTTATCGCGTAGCTCCAG  >  minE/1938584‑1938621                                      | tACAACACTTCAAGCATGGCTTTATCGCGTAGCTCCAg  >  1:1224319/1‑38 (MQ=255) tACAACACTTCAAGCATGGCTTTATCGCGTAGCTCCAg  >  1:1548098/1‑38 (MQ=255) tACAACACTTCAAGCATGGCTTTATCGCGTAGCTCCAg  >  1:1892687/1‑38 (MQ=255) tACAACACTTCAAGCATGGCTTTATCGCGTAGCTCCAg  >  1:2239239/1‑38 (MQ=255) tACAACACTTCAAGCATGGCTTTATCGCGTAGCTCCAg  >  1:2811012/1‑38 (MQ=255) tACAACACTTCAAGCATGGCTTTATCGCGTAGCTCCAg  >  1:353523/1‑38 (MQ=255) tACAACACTTCAAGCATGGCTTTATCGCGTAGCTCCAg  >  1:50712/1‑38 (MQ=255) tACAACACTTCAAGCATGGCTTTATCGCGTAGCTCCAg  >  1:797751/1‑38 (MQ=255) tACAACACTTCAAGCATGGCTTTATCGCGTAGCTCCAg  >  1:807227/1‑38 (MQ=255) tACAACACTTCAAGCATGGCTTTATCGCGTAGCTCCAg  >  1:896400/1‑38 (MQ=255) tACAACACTTCAAGCATGGCTTTATCGCGTAGCTCCAg  >  1:907440/1‑38 (MQ=255) tACAACACTTCAAGCATGGCTTTATCGCGTAGCTCCAg  >  1:978735/1‑38 (MQ=255) tACAACACTTCAAGCATGGCTTTATCGCGTAGCTCAAg  >  1:537255/1‑38 (MQ=255)                                      | TACAACACTTCAAGCATGGCTTTATCGCGTAGCTCCAG  >  minE/1938584‑1938621

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑