Missing coverage evidence...
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ATGCGGTGAATACGGTCACGCTTTTTCGTCCCGCTCCAGTAGCGTCGCAGCAGGAATATCAGGCCTCCCGC  >  minE/1998554‑1998624                                                                       | aTGCGGTGAATACGGTCACGCTTTTTCGTCCCGCTCCAGTAGCGTCGCAGCAGGAATATCAGGCCTCCCGc  <  1:2993401/71‑1 (MQ=255) aTGCGGTGAATACGGTCACGCTTTTTCGTCCCGCTCCAGTAGCGTCGCAGCAGGAATATCAGGCCTCCCGc  <  1:980048/71‑1 (MQ=255) aTGCGGTGAATACGGTCACGCTTTTTCGTCCCGCTCCAGTAGCGTCGCAGCAGGAATATCAGGCCTCCCGc  <  1:778171/71‑1 (MQ=255) aTGCGGTGAATACGGTCACGCTTTTTCGTCCCGCTCCAGTAGCGTCGCAGCAGGAATATCAGGCCTCCCGc  <  1:720385/71‑1 (MQ=255) aTGCGGTGAATACGGTCACGCTTTTTCGTCCCGCTCCAGTAGCGTCGCAGCAGGAATATCAGGCCTCCCGc  <  1:66698/71‑1 (MQ=255) aTGCGGTGAATACGGTCACGCTTTTTCGTCCCGCTCCAGTAGCGTCGCAGCAGGAATATCAGGCCTCCCGc  <  1:666133/71‑1 (MQ=255) aTGCGGTGAATACGGTCACGCTTTTTCGTCCCGCTCCAGTAGCGTCGCAGCAGGAATATCAGGCCTCCCGc  <  1:61420/71‑1 (MQ=255) aTGCGGTGAATACGGTCACGCTTTTTCGTCCCGCTCCAGTAGCGTCGCAGCAGGAATATCAGGCCTCCCGc  <  1:513704/71‑1 (MQ=255) aTGCGGTGAATACGGTCACGCTTTTTCGTCCCGCTCCAGTAGCGTCGCAGCAGGAATATCAGGCCTCCCGc  <  1:505491/71‑1 (MQ=255) aTGCGGTGAATACGGTCACGCTTTTTCGTCCCGCTCCAGTAGCGTCGCAGCAGGAATATCAGGCCTCCCGc  <  1:315176/71‑1 (MQ=255) aTGCGGTGAATACGGTCACGCTTTTTCGTCCCGCTCCAGTAGCGTCGCAGCAGGAATATCAGGCCTCCCGc  <  1:3061015/71‑1 (MQ=255) aTGCGGTGAATACGGTCACGCTTTTTCGTCCCGCTCCAGTAGCGTCGCAGCAGGAATATCAGGCCTCCCGc  <  1:1220847/71‑1 (MQ=255) aTGCGGTGAATACGGTCACGCTTTTTCGTCCCGCTCCAGTAGCGTCGCAGCAGGAATATCAGGCCTCCCGc  <  1:2576240/71‑1 (MQ=255) aTGCGGTGAATACGGTCACGCTTTTTCGTCCCGCTCCAGTAGCGTCGCAGCAGGAATATCAGGCCTCCCGc  <  1:2553235/71‑1 (MQ=255) aTGCGGTGAATACGGTCACGCTTTTTCGTCCCGCTCCAGTAGCGTCGCAGCAGGAATATCAGGCCTCCCGc  <  1:227236/71‑1 (MQ=255) aTGCGGTGAATACGGTCACGCTTTTTCGTCCCGCTCCAGTAGCGTCGCAGCAGGAATATCAGGCCTCCCGc  <  1:2195033/71‑1 (MQ=255) aTGCGGTGAATACGGTCACGCTTTTTCGTCCCGCTCCAGTAGCGTCGCAGCAGGAATATCAGGCCTCCCGc  <  1:2053576/71‑1 (MQ=255) aTGCGGTGAATACGGTCACGCTTTTTCGTCCCGCTCCAGTAGCGTCGCAGCAGGAATATCAGGCCTCCCGc  <  1:203935/71‑1 (MQ=255) aTGCGGTGAATACGGTCACGCTTTTTCGTCCCGCTCCAGTAGCGTCGCAGCAGGAATATCAGGCCTCCCGc  <  1:1946666/71‑1 (MQ=255) aTGCGGTGAATACGGTCACGCTTTTTCGTCCCGCTCCAGTAGCGTCGCAGCAGGAATATCAGGCCTCCCGc  <  1:1699629/71‑1 (MQ=255) aTGCGGTGAATACGGTCACGCTTTTTCGTCCCGCTCCAGTAGCGTCGCAGCAGGAATATCAGGCCTCCCGc  <  1:1441539/71‑1 (MQ=255) aTGCGGTGAATACGGTCACGCTTTTTCGTCCCGCTCCAGTAGCGTCGCAGCAGGAATATCAGGCCTCCCGc  <  1:1412682/71‑1 (MQ=255)  tGCGGTGAATACGGTCACGCTTTTTCGTCCCGCTCCAGTAGCGTCGCAGCAGGAATATCAGGCCTCCCGc  <  1:2674087/70‑1 (MQ=255)                     cTTTTTCGTCCCGCTCCAGTAGCGTCGCAGCAGGAATATCAGGCCTCCCGc  <  1:563134/51‑1 (MQ=255)                                                                       | ATGCGGTGAATACGGTCACGCTTTTTCGTCCCGCTCCAGTAGCGTCGCAGCAGGAATATCAGGCCTCCCGC  >  minE/1998554‑1998624

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑