Missing coverage evidence...
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GCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGG  >  minE/2164317‑2164386                                                                      | gccaCGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCCGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCgg  >  1:2196783/4‑70 (MQ=255) gCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCgg  >  1:2571404/1‑70 (MQ=255) gCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCgg  >  1:741208/1‑70 (MQ=255) gCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCgg  >  1:723437/1‑70 (MQ=255) gCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCgg  >  1:411584/1‑70 (MQ=255) gCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCgg  >  1:3291974/1‑70 (MQ=255) gCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCgg  >  1:3207606/1‑70 (MQ=255) gCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCgg  >  1:3159258/1‑70 (MQ=255) gCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCgg  >  1:3134290/1‑70 (MQ=255) gCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCgg  >  1:306988/1‑70 (MQ=255) gCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCgg  >  1:3069751/1‑70 (MQ=255) gCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCgg  >  1:2872574/1‑70 (MQ=255) gCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCgg  >  1:1508703/1‑70 (MQ=255) gCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCgg  >  1:2549337/1‑70 (MQ=255) gCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCgg  >  1:2544248/1‑70 (MQ=255) gCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCgg  >  1:2540439/1‑70 (MQ=255) gCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCgg  >  1:2518535/1‑70 (MQ=255) gCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCgg  >  1:2269420/1‑70 (MQ=255) gCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCgg  >  1:212941/1‑70 (MQ=255) gCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCgg  >  1:204868/1‑70 (MQ=255) gCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCgg  >  1:1993214/1‑70 (MQ=255) gCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCgg  >  1:1775318/1‑70 (MQ=255)                                                                      | GCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGG  >  minE/2164317‑2164386

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑