Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2248394	2248409	16	22 [0]	[0] 38	thiE	thiamin phosphate synthase

GGTGGAAGCCGATGTCGTGGCGGCAATTGCGCTGGGCCGCCGCTATAACGCGCGATTGTTTATCAACGATT  >  minE/2248323‑2248393                                                                       | ggTGGAAGCCGATGTCGTGGCGGCAATTGCGCTGGGCCGCCGCTATAACGCGCGATTGTTTATCAACGAtt  <  1:1063279/71‑1 (MQ=255) ggTGGAAGCCGATGTCGTGGCGGCAATTGCGCTGGGCCGCCGCTATAACGCGCGATTGTTTATCAACGAtt  <  1:938960/71‑1 (MQ=255) ggTGGAAGCCGATGTCGTGGCGGCAATTGCGCTGGGCCGCCGCTATAACGCGCGATTGTTTATCAACGAtt  <  1:559205/71‑1 (MQ=255) ggTGGAAGCCGATGTCGTGGCGGCAATTGCGCTGGGCCGCCGCTATAACGCGCGATTGTTTATCAACGAtt  <  1:523257/71‑1 (MQ=255) ggTGGAAGCCGATGTCGTGGCGGCAATTGCGCTGGGCCGCCGCTATAACGCGCGATTGTTTATCAACGAtt  <  1:410335/71‑1 (MQ=255) ggTGGAAGCCGATGTCGTGGCGGCAATTGCGCTGGGCCGCCGCTATAACGCGCGATTGTTTATCAACGAtt  <  1:3052265/71‑1 (MQ=255) ggTGGAAGCCGATGTCGTGGCGGCAATTGCGCTGGGCCGCCGCTATAACGCGCGATTGTTTATCAACGAtt  <  1:3016417/71‑1 (MQ=255) ggTGGAAGCCGATGTCGTGGCGGCAATTGCGCTGGGCCGCCGCTATAACGCGCGATTGTTTATCAACGAtt  <  1:2855287/71‑1 (MQ=255) ggTGGAAGCCGATGTCGTGGCGGCAATTGCGCTGGGCCGCCGCTATAACGCGCGATTGTTTATCAACGAtt  <  1:2738776/71‑1 (MQ=255) ggTGGAAGCCGATGTCGTGGCGGCAATTGCGCTGGGCCGCCGCTATAACGCGCGATTGTTTATCAACGAtt  <  1:2655327/71‑1 (MQ=255) ggTGGAAGCCGATGTCGTGGCGGCAATTGCGCTGGGCCGCCGCTATAACGCGCGATTGTTTATCAACGAtt  <  1:2291362/71‑1 (MQ=255) ggTGGAAGCCGATGTCGTGGCGGCAATTGCGCTGGGCCGCCGCTATAACGCGCGATTGTTTATCAACGAtt  <  1:2143170/71‑1 (MQ=255) ggTGGAAGCCGATGTCGTGGCGGCAATTGCGCTGGGCCGCCGCTATAACGCGCGATTGTTTATCAACGAtt  <  1:2124011/71‑1 (MQ=255) ggTGGAAGCCGATGTCGTGGCGGCAATTGCGCTGGGCCGCCGCTATAACGCGCGATTGTTTATCAACGAtt  <  1:211201/71‑1 (MQ=255) ggTGGAAGCCGATGTCGTGGCGGCAATTGCGCTGGGCCGCCGCTATAACGCGCGATTGTTTATCAACGAtt  <  1:1879552/71‑1 (MQ=255) ggTGGAAGCCGATGTCGTGGCGGCAATTGCGCTGGGCCGCCGCTATAACGCGCGATTGTTTATCAACGAtt  <  1:187694/71‑1 (MQ=255) ggTGGAAGCCGATGTCGTGGCGGCAATTGCGCTGGGCCGCCGCTATAACGCGCGATTGTTTATCAACGAtt  <  1:1562306/71‑1 (MQ=255) ggTGGAAGCCGATGTCGTGGCGGCAATTGCGCTGGGCCGCCGCTATAACGCGCGATTGTTTATCAACGAtt  <  1:1037804/71‑1 (MQ=255)  gTGGAAGCCGATGTCGTGGCGGCAATTGCGCTGGGCCGCCGCTATAACGCGCGATTGTTTATCAACGAtt  <  1:2354325/70‑1 (MQ=255)  gTGGAAGCCGATGTCGTGGCGGCAATTGCGCTGGGCCGCCGCTATAACGCGCGATTGTTTATCAACGAtt  <  1:1747453/70‑1 (MQ=255)                                   ggCCGCCGCTATAACGCGCGATTGTTTATCAACGAtt  <  1:952191/37‑1 (MQ=255)                                    gccgccGCTATAACGCGCGATTGTTTATCAACGAtt  <  1:2756536/36‑1 (MQ=255)                                                                       | GGTGGAAGCCGATGTCGTGGCGGCAATTGCGCTGGGCCGCCGCTATAACGCGCGATTGTTTATCAACGATT  >  minE/2248323‑2248393

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑