Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2343238	2343248	11	14 [0]	[1] 45	glnL	sensory kinase in two‑component regulatory system with GlnG

TACGCTGTTTTACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGCTCGTAATT  >  minE/2343167‑2343237                                                                       | tACGCTGTTTTACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGCTCGTAAtt  >  1:1198518/1‑71 (MQ=255) tACGCTGTTTTACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGCTCGTAAtt  >  1:1381978/1‑71 (MQ=255) tACGCTGTTTTACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGCTCGTAAtt  >  1:1436187/1‑71 (MQ=255) tACGCTGTTTTACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGCTCGTAAtt  >  1:1511981/1‑71 (MQ=255) tACGCTGTTTTACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGCTCGTAAtt  >  1:1554878/1‑71 (MQ=255) tACGCTGTTTTACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGCTCGTAAtt  >  1:1893046/1‑71 (MQ=255) tACGCTGTTTTACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGCTCGTAAtt  >  1:2554382/1‑71 (MQ=255) tACGCTGTTTTACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGCTCGTAAtt  >  1:2763602/1‑71 (MQ=255) tACGCTGTTTTACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGCTCGTAAtt  >  1:2981668/1‑71 (MQ=255) tACGCTGTTTTACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGCTCGTAAtt  >  1:3098031/1‑71 (MQ=255) tACGCTGTTTTACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGCTCGTAAtt  >  1:3116594/1‑71 (MQ=255) tACGCTGTTTTACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGCTCGTAAtt  >  1:321370/1‑71 (MQ=255) tACGCTGTTTTACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGCTCGTAAtt  >  1:3236442/1‑71 (MQ=255) tACGCTGTTTTACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGCTCATAAtt  >  1:1575628/1‑71 (MQ=255)                                                                       | TACGCTGTTTTACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGCTCGTAATT  >  minE/2343167‑2343237

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑