Missing coverage evidence...
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AACACATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTC  >  minE/2359915‑2359985                                                                       | aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:2556609/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:989528/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:916412/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:729890/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:663926/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:438222/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:434783/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:3286206/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:3093843/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:3015082/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:2737390/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:2719799/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:2703291/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:2577904/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:1035510/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:2515156/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:1526823/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:1075874/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:1084289/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:1090372/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:1291545/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:1294230/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:250693/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:153769/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:1609167/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:1769631/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:1901694/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:1979150/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:2092956/71‑1 (MQ=255) aacaCATAGTGTCGCTGCCGAAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:2677219/71‑1 (MQ=255)  acacATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:1430811/70‑1 (MQ=255)  acacATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:962561/70‑1 (MQ=255)  acacATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:964455/70‑1 (MQ=255)  acacATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTc  <  1:2438094/70‑1 (MQ=255)                                                                       | AACACATAGTGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGTTACATCTTCCGCGCAGGCCGACTC  >  minE/2359915‑2359985

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑