Missing coverage evidence...
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AAACTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCA  >  minE/2649282‑2649352                                                                       | aaaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCATGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:3148992/71‑1 (MQ=255) aaaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:1318430/71‑1 (MQ=255) aaaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:995501/71‑1 (MQ=255) aaaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:885746/71‑1 (MQ=255) aaaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:87039/71‑1 (MQ=255) aaaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:64782/71‑1 (MQ=255) aaaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:296681/71‑1 (MQ=255) aaaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:2321826/71‑1 (MQ=255) aaaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:2173836/71‑1 (MQ=255) aaaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:187800/71‑1 (MQ=255) aaaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:1528965/71‑1 (MQ=255) aaaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:180939/71‑1 (MQ=255) aaaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:1751321/71‑1 (MQ=255) aaaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:1644784/71‑1 (MQ=255)  aaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACGATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:432115/70‑1 (MQ=255)  aaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:116319/70‑1 (MQ=255)  aaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:1365949/70‑1 (MQ=255)  aaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:837334/70‑1 (MQ=255)  aaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:757704/70‑1 (MQ=255)  aaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:727181/70‑1 (MQ=255)  aaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:642628/70‑1 (MQ=255)  aaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:638727/70‑1 (MQ=255)  aaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:512041/70‑1 (MQ=255)  aaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:2946740/70‑1 (MQ=255)  aaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:2750841/70‑1 (MQ=255)  aaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:2662115/70‑1 (MQ=255)  aaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:2591739/70‑1 (MQ=255)  aaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:1781109/70‑1 (MQ=255)  aaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:1980422/70‑1 (MQ=255)  aaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:1935406/70‑1 (MQ=255)  aaCTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGGGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:1562781/70‑1 (MQ=255)                              ccAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCa  <  1:1830506/42‑1 (MQ=255)                                                                       | AAACTACTGTTCATGGGTAACGAATTTGCCCAGGGCCGCGAGTGGAACCATGACGCCAGCCTCGACTGGCA  >  minE/2649282‑2649352

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑