Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	11213	11274	62	35 [0]	[1] 27	yaaW htgA	conserved hypothetical protein hypothetical protein

TGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTAAA  >  minE/11142‑11212                                                                       | tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:108781/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:994311/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:946314/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:636160/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:356644/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:346373/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:3241712/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:3054886/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:2856560/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:2725483/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:2586378/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:2540117/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:233607/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:2280152/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:2273051/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:2154900/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:1661268/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:102967/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:1112169/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:114854/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:1378921/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:142893/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:1568752/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:2058758/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:1689836/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:1767148/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:190907/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:1998834/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:2029876/71‑1 (MQ=255)  gCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:300596/70‑1 (MQ=255)  gCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:1244284/70‑1 (MQ=255)  gCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:2128468/70‑1 (MQ=255)  gCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:2075014/70‑1 (MQ=255)                 cAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:141954/55‑1 (MQ=255)                                   ggcgATGTTGCGCGGGATGCCCTTCCATCGATTTaaa  <  1:1666060/37‑1 (MQ=255)                                                                       | TGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCTTCCATCGATTTAAA  >  minE/11142‑11212

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑