Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	99538	99560	23	22 [0]	[0] 10	hofC	assembly protein in type IV pilin biogenesis, transmembrane protein

GCAAACAGAGCGGGCTAAACTCACCGGTATTTTTTAGCGCCAGCCAGATGGGTTGACC  >  minE/99480‑99537                                                          | gCAAACAGAGCGGGCTAAACTCACCGGTATTTTTTAGCGCCCGCCAGATGGGTTGAcc  >  1:1502126/1‑58 (MQ=255) gCAAACAGAGCGGGCTAAACTCACCGGTATTTTTTAGCGCCAGCCAGATGGGTTGAcc  >  1:1802425/1‑58 (MQ=255) gCAAACAGAGCGGGCTAAACTCACCGGTATTTTTTAGCGCCAGCCAGATGGGTTGAcc  >  1:975270/1‑58 (MQ=255) gCAAACAGAGCGGGCTAAACTCACCGGTATTTTTTAGCGCCAGCCAGATGGGTTGAcc  >  1:932596/1‑58 (MQ=255) gCAAACAGAGCGGGCTAAACTCACCGGTATTTTTTAGCGCCAGCCAGATGGGTTGAcc  >  1:88514/1‑58 (MQ=255) gCAAACAGAGCGGGCTAAACTCACCGGTATTTTTTAGCGCCAGCCAGATGGGTTGAcc  >  1:863434/1‑58 (MQ=255) gCAAACAGAGCGGGCTAAACTCACCGGTATTTTTTAGCGCCAGCCAGATGGGTTGAcc  >  1:454277/1‑58 (MQ=255) gCAAACAGAGCGGGCTAAACTCACCGGTATTTTTTAGCGCCAGCCAGATGGGTTGAcc  >  1:438754/1‑58 (MQ=255) gCAAACAGAGCGGGCTAAACTCACCGGTATTTTTTAGCGCCAGCCAGATGGGTTGAcc  >  1:328013/1‑58 (MQ=255) gCAAACAGAGCGGGCTAAACTCACCGGTATTTTTTAGCGCCAGCCAGATGGGTTGAcc  >  1:3158731/1‑58 (MQ=255) gCAAACAGAGCGGGCTAAACTCACCGGTATTTTTTAGCGCCAGCCAGATGGGTTGAcc  >  1:2179567/1‑58 (MQ=255) gCAAACAGAGCGGGCTAAACTCACCGGTATTTTTTAGCGCCAGCCAGATGGGTTGAcc  >  1:2160674/1‑58 (MQ=255) gCAAACAGAGCGGGCTAAACTCACCGGTATTTTTTAGCGCCAGCCAGATGGGTTGAcc  >  1:1119445/1‑58 (MQ=255) gCAAACAGAGCGGGCTAAACTCACCGGTATTTTTTAGCGCCAGCCAGATGGGTTGAcc  >  1:1552614/1‑58 (MQ=255) gCAAACAGAGCGGGCTAAACTCACCGGTATTTTTTAGCGCCAGCCAGATGGGTTGAcc  >  1:1468261/1‑58 (MQ=255) gCAAACAGAGCGGGCTAAACTCACCGGTATTTTTTAGCGCCAGCCAGATGGGTTGAcc  >  1:1328719/1‑58 (MQ=255) gCAAACAGAGCGGGCTAAACTCACCGGTATTTTTTAGCGCCAGCCAGATGGGTTGAcc  >  1:1305506/1‑58 (MQ=255) gCAAACAGAGCGGGCTAAACTCACCGGTATTTTTTAGCGCCAGCCAGATGGGTTGAcc  >  1:1262368/1‑58 (MQ=255) gCAAACAGAGCGGGCTAAACTCACCGGTATTTTTTAGCGCCAGCCAGATGGGTTGAcc  >  1:1222905/1‑58 (MQ=255) gCAAACAGAGCGGGCTAAACTCACCGGTATTTTTTAGCGCCAGCCAGATGGGTTGAcc  >  1:1168823/1‑58 (MQ=255) gCAAACAGAGCGGGCTAAACTCACCGGTATTTTTTAGCGCCAGCCAGATGGGTTGAcc  >  1:116754/1‑58 (MQ=255) gCAAACAGAGCGGGCTAAACTCACCGGTATTTTTTAGCGCCAGCCAGATGGGTTGAcc  >  1:1153694/1‑58 (MQ=255)                                                          | GCAAACAGAGCGGGCTAAACTCACCGGTATTTTTTAGCGCCAGCCAGATGGGTTGACC  >  minE/99480‑99537

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑