Missing coverage evidence...
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CGGCAACATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACT  >  minE/485668‑485738                                                                       | cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:2812457/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:2426423/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:1000286/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:2522608/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:2527958/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:2724524/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:2748737/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:2801417/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:2802425/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:2464234/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:298359/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:3020860/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:3076146/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:3218473/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:373395/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:436409/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:854260/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:863488/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:1709106/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:1305951/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:1539797/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:1657445/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:1660519/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:1693981/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:169590/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:2408590/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:1831680/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:1879565/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:1958692/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:1985845/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:2038990/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:2112879/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:2244645/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:2309215/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:2352688/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGAAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:423266/71‑1 (MQ=255) cggcaacATGTCTTCAGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:474520/71‑1 (MQ=255) cgacaacATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACt  <  1:3130559/68‑1 (MQ=255)                                                                       | CGGCAACATGTCTTCCGAAGAGCAGGCTCGTCTGCAAATGCAACAGCTGCAGCAGAACAACATCGTTTACT  >  minE/485668‑485738

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑