Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	540191	540198	8	8 [0]	[0] 3	rhtA	threonine and homoserine efflux system

GTAAATTTAATTAATGTCTAATTCTTTTATTTTGCTCTCTTTGCGTACTGTCAGCGTAGACCCCATTGAA  >  minE/540121‑540190                                                                      | gTAAATTTAATTAATGTCTAATTCTTTTATTTTGCTCTCTTTGCGTACTGTCAGCGTAGACCCCATTGaa  <  1:1229592/70‑1 (MQ=255) gTAAATTTAATTAATGTCTAATTCTTTTATTTTGCTCTCTTTGCGTACTGTCAGCGTAGACCCCATTGaa  <  1:1282549/70‑1 (MQ=255) gTAAATTTAATTAATGTCTAATTCTTTTATTTTGCTCTCTTTGCGTACTGTCAGCGTAGACCCCATTGaa  <  1:2007236/70‑1 (MQ=255) gTAAATTTAATTAATGTCTAATTCTTTTATTTTGCTCTCTTTGCGTACTGTCAGCGTAGACCCCATTGaa  <  1:43195/70‑1 (MQ=255) gTAAATTTAATTAATGTCTAATTCTTTTATTTTGCTCTCTTTGCGTACTGTCAGCGTAGACCCCATTGaa  <  1:912109/70‑1 (MQ=255)   aaaTTTAATTAATGTCTAATTCTTTTATTTTGCTCTCTTTGCGTACTGTCAGCGTAGACCCCATTGaa  <  1:1625204/68‑1 (MQ=255)                              ttttGCTCTCTTTGCGTACTGTCAGCGTAGACCCCATTGaa  <  1:1571298/41‑1 (MQ=255)                                  gCTCTCTTTGCGTACTGTCAGCGTAGACCCCATTGaa  <  1:2849610/37‑1 (MQ=255)                                                                      | GTAAATTTAATTAATGTCTAATTCTTTTATTTTGCTCTCTTTGCGTACTGTCAGCGTAGACCCCATTGAA  >  minE/540121‑540190

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑