Missing coverage evidence...
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GGCTATAAGGAAAGGCCAAACAAGAACACGGTTGCAAAAACCGTGCCCTTAAATATTGAATCTCTATTCAG  >  minE/849456‑849526 |                                                                       ggCTATAAGGAAAGGCCAAACAAGAACACGGTTGCAAAAACCGTGCCCTTAAGTATTGAATCTCTAtt     >  1:1353420/1‑68 (MQ=255) ggCTATAAGGAAAGGCCAAACAAGAACACGGTTGCAAAAACCGTGCCCTTAAATATTGAATCTCTAtt     >  1:2244039/1‑68 (MQ=255) ggCTATAAGGAAAGGCCAAACAAGAACACGGTTGCAAAAACCGTGCCCTTAAATATTGAATCTCTAtt     >  1:883902/1‑68 (MQ=255) ggCTATAAGGAAAGGCCAAACAAGAACACGGTTGCAAAAACCGTGCCCTTAAATATTGAATCTCTAtt     >  1:837253/1‑68 (MQ=255) ggCTATAAGGAAAGGCCAAACAAGAACACGGTTGCAAAAACCGTGCCCTTAAATATTGAATCTCTAtt     >  1:806821/1‑68 (MQ=255) ggCTATAAGGAAAGGCCAAACAAGAACACGGTTGCAAAAACCGTGCCCTTAAATATTGAATCTCTAtt     >  1:796268/1‑68 (MQ=255) ggCTATAAGGAAAGGCCAAACAAGAACACGGTTGCAAAAACCGTGCCCTTAAATATTGAATCTCTAtt     >  1:605281/1‑68 (MQ=255) ggCTATAAGGAAAGGCCAAACAAGAACACGGTTGCAAAAACCGTGCCCTTAAATATTGAATCTCTAtt     >  1:35978/1‑68 (MQ=255) ggCTATAAGGAAAGGCCAAACAAGAACACGGTTGCAAAAACCGTGCCCTTAAATATTGAATCTCTAtt     >  1:354727/1‑68 (MQ=255) ggCTATAAGGAAAGGCCAAACAAGAACACGGTTGCAAAAACCGTGCCCTTAAATATTGAATCTCTAtt     >  1:3238642/1‑68 (MQ=255) ggCTATAAGGAAAGGCCAAACAAGAACACGGTTGCAAAAACCGTGCCCTTAAATATTGAATCTCTAtt     >  1:2902006/1‑68 (MQ=255) ggCTATAAGGAAAGGCCAAACAAGAACACGGTTGCAAAAACCGTGCCCTTAAATATTGAATCTCTAtt     >  1:2770959/1‑68 (MQ=255) ggCTATAAGGAAAGGCCAAACAAGAACACGGTTGCAAAAACCGTGCCCTTAAATATTGAATCTCTAtt     >  1:2695820/1‑68 (MQ=255) ggCTATAAGGAAAGGCCAAACAAGAACACGGTTGCAAAAACCGTGCCCTTAAATATTGAATCTCTAtt     >  1:1001419/1‑68 (MQ=255) ggCTATAAGGAAAGGCCAAACAAGAACACGGTTGCAAAAACCGTGCCCTTAAATATTGAATCTCTAtt     >  1:216925/1‑68 (MQ=255) ggCTATAAGGAAAGGCCAAACAAGAACACGGTTGCAAAAACCGTGCCCTTAAATATTGAATCTCTAtt     >  1:1855472/1‑68 (MQ=255) ggCTATAAGGAAAGGCCAAACAAGAACACGGTTGCAAAAACCGTGCCCTTAAATATTGAATCTCTAtt     >  1:1658158/1‑68 (MQ=255) ggCTATAAGGAAAGGCCAAACAAGAACACGGTTGCAAAAACCGTGCCCTTAAATATTGAATCTCTAtt     >  1:1618442/1‑68 (MQ=255) ggCTATAAGGAAAGGCCAAACAAGAACACGGTTGCAAAAACCGTGCCCTTAAATATTGAATCTCTAtt     >  1:1591217/1‑68 (MQ=255) ggCTATAAGGAAAGGCCAAACAAGAACACGGTTGCAAAAACCGTGCCCTTAAATATTGAATCTCTAtt     >  1:1525321/1‑68 (MQ=255) ggCTATAAGGAAAGGCCAAACAAGAACACGGTTGCAAAAACCGTGCCCTTAAATATTGAATCTCTAtt     >  1:1458383/1‑68 (MQ=255) ggCTATAAGGAAAGGCCAAACAAGAACACGGTTGCAAAAACCGTGCCCTTAAATATTGAATCTCTAtt     >  1:1408407/1‑68 (MQ=255) ggCTATAAGGAAAGGCCAAACAAGAACACGGTTGCAAAAACCGTGCCCTTAAATATTGAATCTCTAtt     >  1:1365455/1‑68 (MQ=255) ggCTATAAGGAAAGGCCAAACAAGAACACGGTTGCAAAAACCGTGCCCTTAAATATTGAATCTCTAt      >  1:1259742/1‑67 (MQ=255) ggCTATAAGGAAAGGCCAAACAAGAACACGGTTG‑AAAAACCGTGCCCTTAAATATTGAATCTCTATTAAg  >  1:340079/1‑70 (MQ=255) |                                                                       GGCTATAAGGAAAGGCCAAACAAGAACACGGTTGCAAAAACCGTGCCCTTAAATATTGAATCTCTATTCAG  >  minE/849456‑849526

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑