Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1217802	1217806	5	33 [0]	[0] 43	prc	carboxy‑terminal protease for penicillin‑binding protein 3

CCTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAC  >  minE/1217807‑1217876 |                                                                      ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCCGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTgcc  >  1:2867666/1‑68 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGt                          >  1:1557409/1‑46 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCa                        >  1:1365682/1‑48 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCTGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:1188452/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGt       >  1:1190130/1‑65 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTgcc  >  1:359913/1‑68 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTg    >  1:1464362/1‑68 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGa   >  1:2929705/1‑69 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGa   >  1:2051291/1‑69 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGa   >  1:398351/1‑69 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGa   >  1:2808496/1‑69 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGa   >  1:165560/1‑69 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:2885052/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:2541548/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:2791804/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:2703713/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:2279201/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:2905048/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:2926186/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:2963514/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:2964201/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:3291016/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:431393/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:901479/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:980240/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:1126215/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:2344295/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:2328526/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:1106777/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:2093640/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:2048796/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:1373144/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:2010395/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:2442101/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:1373695/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:1743307/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:1532614/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:1529764/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:1393480/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCCGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:1994264/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCACCGGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:1911998/1‑70 (MQ=255) ccTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCAAGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGa   >  1:2035922/1‑69 (MQ=255) ccTATAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCTGCTTGCCTGTTTGAc  >  1:2355547/1‑70 (MQ=255) |                                                                      CCTTTAATTAAGGCAACCACATCATCAAGACGCCAGCCAATCACGTCAACCATCGGCTTGCCTGTTTGAC  >  minE/1217807‑1217876

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑