Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1242438	1242445	8	19 [0]	[0] 40	pykA	pyruvate kinase II

GATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGT  >  minE/1242446‑1242516 |                                                                       gATGCCGCCGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:949067/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCg                                >  1:412910/1‑41 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCt    >  1:1228587/1‑69 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTg   >  1:2283129/1‑70 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTg   >  1:569695/1‑70 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:596821/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:2677061/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:291174/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:2932711/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:3094783/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:372970/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:384020/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:1408163/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:1449624/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:648705/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:740775/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:77452/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:800437/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:811373/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:861861/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:91613/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:1038726/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:2197841/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:1435558/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:1718531/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:1724894/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:1906626/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:1914160/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:1931515/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:2052395/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:2119065/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:2635243/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:2216495/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:2300865/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:237030/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:2407572/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:2455661/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:2498546/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:2607759/1‑71 (MQ=255) gATGCCGACGCGAGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGt  >  1:262595/1‑71 (MQ=255) |                                                                       GATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAGCAAACGCCGTTCTGGATGGTACTGACGCTGTGATGCTGT  >  minE/1242446‑1242516

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑