Missing coverage evidence...
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TTGACCCAACCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACG  >  minE/1254365‑1254435 |                                                                       ttGACCCAACCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACg  <  1:1971856/71‑1 (MQ=255) ttGACCCAACCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACg  <  1:724487/71‑1 (MQ=255) ttGACCCAACCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACg  <  1:691684/71‑1 (MQ=255) ttGACCCAACCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACg  <  1:3203865/71‑1 (MQ=255) ttGACCCAACCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACg  <  1:3105462/71‑1 (MQ=255) ttGACCCAACCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACg  <  1:3020320/71‑1 (MQ=255) ttGACCCAACCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACg  <  1:283634/71‑1 (MQ=255) ttGACCCAACCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACg  <  1:2626387/71‑1 (MQ=255) ttGACCCAACCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACg  <  1:2477682/71‑1 (MQ=255) ttGACCCAACCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACg  <  1:1972825/71‑1 (MQ=255) ttGACCCAACCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACg  <  1:1099887/71‑1 (MQ=255) ttGACCCAACCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACg  <  1:1865963/71‑1 (MQ=255) ttGACCCAACCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACg  <  1:1824595/71‑1 (MQ=255) ttGACCCAACCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACg  <  1:1514249/71‑1 (MQ=255) ttGACCCAACCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACg  <  1:1503808/71‑1 (MQ=255) ttGACCCAACCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACg  <  1:1437609/71‑1 (MQ=255) ttGACCCAACCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACg  <  1:1433877/71‑1 (MQ=255) ttGACCCAACCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACg  <  1:1367/71‑1 (MQ=255) ttGACCCAACCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACg  <  1:112076/71‑1 (MQ=255) |                                                                       TTGACCCAACCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACG  >  minE/1254365‑1254435

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑