Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1466401	1466464	64	2 [1]	[0] 41	gyrA	DNA gyrase (type II topoisomerase), subunit A

CGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCA  >  minE/1466465‑1466535 |                                                                       cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:3053133/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:2502886/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:2596105/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:2646778/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:2665289/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:267182/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:2675258/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:2763791/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:289703/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:2962308/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:3015891/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:2460699/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:3240780/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:407792/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:538304/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:608404/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:643611/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:71220/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:812109/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:834537/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:881030/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:1917404/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:1052731/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:1094159/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:1118673/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:1142024/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:1184742/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:1345476/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:1726067/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:179159/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:1813770/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:1024292/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:1926057/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:1952074/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:2034100/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:2286416/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:2346412/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:2377008/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:2422151/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:2425109/71‑1 (MQ=255) cGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCa  <  1:2425992/71‑1 (MQ=255) |                                                                       CGTTCACCAGCAGGTTAGGAATTTTGGTTGGCATGACGTCCGGAATTTTTTCCGTGCCGTCATAGTTATCA  >  minE/1466465‑1466535

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑