Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1520684	1520686	3	6 [0]	[0] 33	truA	pseudouridylate synthase I

GCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTGG  >  minE/1520687‑1520757 |                                                                       gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCGGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:1504702/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:2621943/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:2116590/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:2146001/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:2159910/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:2430492/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:2435612/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:2461300/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:2615331/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:1851176/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:2813126/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:2893886/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:2961749/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:2977273/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:603594/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:643151/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:888112/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:2068142/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:1076482/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:1795978/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:1752539/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:1625096/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:158792/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:1514163/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:1435157/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:1366481/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:1345652/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:1116531/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:1078646/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTg   >  1:1192672/1‑70 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGCTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:1405621/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCCTGAGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:1545787/1‑71 (MQ=255) gCCCGGTACCGTGTACCCATGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTgg  >  1:1314247/1‑71 (MQ=255) |                                                                       GCCCGGTACCGTGTACCCCTGCGTCAGTACGCCCGGCGCAGAAGACGGTGATGGGTTCGTTCGCCACCTGG  >  minE/1520687‑1520757

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑