Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1634382	1634385	4	40 [0]	[0] 23	acrD	aminoglycoside/multidrug efflux system

TCGATGCCTATGGTTCGCAATATTCCATGCGTATCTGGCTGGACCCGGCGAAACTCAACAGTTTCCA  >  minE/1634386‑1634452 |                                                                   tCGATGCCTATGGTTCGCAATATTCCATGCGTATCTGGCTGTACTCGGCGAAACTCAACAGTTTCCa  <  1:498215/67‑1 (MQ=255) tCGATGCCTATGGTTCGCAATATTCCATGCGTATCTGGCTGGACCCGGCGAAACTCAACAGTTTCCa  <  1:2145016/67‑1 (MQ=255) tCGATGCCTATGGTTCGCAATATTCCATGCGTATCTGGCTGGACCCGGCGAAACTCAACAGTTTCCa  <  1:786633/67‑1 (MQ=255) tCGATGCCTATGGTTCGCAATATTCCATGCGTATCTGGCTGGACCCGGCGAAACTCAACAGTTTCCa  <  1:455626/67‑1 (MQ=255) tCGATGCCTATGGTTCGCAATATTCCATGCGTATCTGGCTGGACCCGGCGAAACTCAACAGTTTCCa  <  1:444400/67‑1 (MQ=255) tCGATGCCTATGGTTCGCAATATTCCATGCGTATCTGGCTGGACCCGGCGAAACTCAACAGTTTCCa  <  1:388127/67‑1 (MQ=255) tCGATGCCTATGGTTCGCAATATTCCATGCGTATCTGGCTGGACCCGGCGAAACTCAACAGTTTCCa  <  1:382248/67‑1 (MQ=255) tCGATGCCTATGGTTCGCAATATTCCATGCGTATCTGGCTGGACCCGGCGAAACTCAACAGTTTCCa  <  1:3284067/67‑1 (MQ=255) tCGATGCCTATGGTTCGCAATATTCCATGCGTATCTGGCTGGACCCGGCGAAACTCAACAGTTTCCa  <  1:3034593/67‑1 (MQ=255) tCGATGCCTATGGTTCGCAATATTCCATGCGTATCTGGCTGGACCCGGCGAAACTCAACAGTTTCCa  <  1:2837450/67‑1 (MQ=255) tCGATGCCTATGGTTCGCAATATTCCATGCGTATCTGGCTGGACCCGGCGAAACTCAACAGTTTCCa  <  1:2622248/67‑1 (MQ=255) tCGATGCCTATGGTTCGCAATATTCCATGCGTATCTGGCTGGACCCGGCGAAACTCAACAGTTTCCa  <  1:2583106/67‑1 (MQ=255) tCGATGCCTATGGTTCGCAATATTCCATGCGTATCTGGCTGGACCCGGCGAAACTCAACAGTTTCCa  <  1:1048225/67‑1 (MQ=255) tCGATGCCTATGGTTCGCAATATTCCATGCGTATCTGGCTGGACCCGGCGAAACTCAACAGTTTCCa  <  1:2014342/67‑1 (MQ=255) tCGATGCCTATGGTTCGCAATATTCCATGCGTATCTGGCTGGACCCGGCGAAACTCAACAGTTTCCa  <  1:2000904/67‑1 (MQ=255) tCGATGCCTATGGTTCGCAATATTCCATGCGTATCTGGCTGGACCCGGCGAAACTCAACAGTTTCCa  <  1:1713694/67‑1 (MQ=255) tCGATGCCTATGGTTCGCAATATTCCATGCGTATCTGGCTGGACCCGGCGAAACTCAACAGTTTCCa  <  1:1703248/67‑1 (MQ=255) tCGATGCCTATGGTTCGCAATATTCCATGCGTATCTGGCTGGACCCGGCGAAACTCAACAGTTTCCa  <  1:1697823/67‑1 (MQ=255) tCGATGCCTATGGTTCGCAATATTCCATGCGTATCTGGCTGGACCCGGCGAAACTCAACAGTTTCCa  <  1:1559966/67‑1 (MQ=255) tCGATGCCTATGGTTCGCAATATTCCATGCGTATCTGGCTGGACCCGGCGAAACTCAACAGTTTCCa  <  1:1351741/67‑1 (MQ=255) tCGATGCCTATGGTTCGCAATATTCCATGCGTATCTGGCTGGACCCGGCGAAACTCAACAGTTTCCa  <  1:1250653/67‑1 (MQ=255) tCGATGCCTATGGTTCGCAATATTCCATGCGTATCTGGCTGGACCCGGCGAAACTCAACAGTTTCCa  <  1:1145261/67‑1 (MQ=255) tCGATGCCTATGGTTCGCAATATTCCATGCGTATCTGGCTGGACCCGGCGAAACTCAACAGTTTCCa  <  1:1120630/67‑1 (MQ=255) |                                                                   TCGATGCCTATGGTTCGCAATATTCCATGCGTATCTGGCTGGACCCGGCGAAACTCAACAGTTTCCA  >  minE/1634386‑1634452

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑