Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2141550	2141552	3	8 [0]	[0] 12	nusA	transcription termination/antitermination L factor

ATCGCTGCGTGCGCTTCCGCCTGATGCTTAGCCTGCAGGTCGTCAACGGTCATCACGTT  >  minE/2141553‑2141611 |                                                           aTCGCTGCGTGCGCTTCCGCCTGATGCTTAGCCTGCAGGTCGTCAACGGTCATCACGtt  <  1:1137252/59‑1 (MQ=255) aTCGCTGCGTGCGCTTCCGCCTGATGCTTAGCCTGCAGGTCGTCAACGGTCATCACGtt  <  1:1234197/59‑1 (MQ=255) aTCGCTGCGTGCGCTTCCGCCTGATGCTTAGCCTGCAGGTCGTCAACGGTCATCACGtt  <  1:1784483/59‑1 (MQ=255) aTCGCTGCGTGCGCTTCCGCCTGATGCTTAGCCTGCAGGTCGTCAACGGTCATCACGtt  <  1:1952181/59‑1 (MQ=255) aTCGCTGCGTGCGCTTCCGCCTGATGCTTAGCCTGCAGGTCGTCAACGGTCATCACGtt  <  1:2305546/59‑1 (MQ=255) aTCGCTGCGTGCGCTTCCGCCTGATGCTTAGCCTGCAGGTCGTCAACGGTCATCACGtt  <  1:261306/59‑1 (MQ=255) aTCGCTGCGTGCGCTTCCGCCTGATGCTTAGCCTGCAGGTCGTCAACGGTCATCACGtt  <  1:3045311/59‑1 (MQ=255) aTCGCTGCGTGCGCTTCCGCCTGATGCTTAGCCTGCAGGTCGTCAACGGTCATCACGtt  <  1:3087922/59‑1 (MQ=255) aTCGCTGCGTGCGCTTCCGCCTGATGCTTAGCCTGCAGGTCGTCAACGGTCATCACGtt  <  1:71184/59‑1 (MQ=255) aTCGCTGCGTGCGCTTCCGCCTGATGCTTAGCCTGCAGGTCGTCAACGGTCATCACGtt  <  1:832937/59‑1 (MQ=255) aTCGCTGCGTGCGCTTCCGCCTGATGCTTAGCCTGCAGGTCGTCAACGGTCATCACGtt  <  1:919598/59‑1 (MQ=255) aTCGCTGCGTGCGCTTCCGCCTGATGCTTAGCCTGCAGGTCGTCAACGGTCAACACGtt  <  1:424289/59‑1 (MQ=255) |                                                           ATCGCTGCGTGCGCTTCCGCCTGATGCTTAGCCTGCAGGTCGTCAACGGTCATCACGTT  >  minE/2141553‑2141611

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑