Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2225104	2225123	20	5 [0]	[0] 20	prmA	methylase for 50S ribosomal subunit protein L11

TTCTGGCAAGCCAGGCAGAGAGCGTTTGTGAAGCTTATGCCGATAGCTTCGCACTGGACCCGG  >  minE/2225124‑2225186 |                                                               ttCTGGCAAGCCAGGCAGAGAGCGTTTGTGAAGCTTATGCCTATAGCTTCGCACTGGACCCgg  <  1:1486055/63‑1 (MQ=255) ttCTGGCAAGCCAGGCAGAGAGCGTTTGTGAAGCTTATGCCGATAGCTTCGCACTGGACCCgg  <  1:2471462/63‑1 (MQ=255) ttCTGGCAAGCCAGGCAGAGAGCGTTTGTGAAGCTTATGCCGATAGCTTCGCACTGGACCCgg  <  1:885514/63‑1 (MQ=255) ttCTGGCAAGCCAGGCAGAGAGCGTTTGTGAAGCTTATGCCGATAGCTTCGCACTGGACCCgg  <  1:482948/63‑1 (MQ=255) ttCTGGCAAGCCAGGCAGAGAGCGTTTGTGAAGCTTATGCCGATAGCTTCGCACTGGACCCgg  <  1:3275746/63‑1 (MQ=255) ttCTGGCAAGCCAGGCAGAGAGCGTTTGTGAAGCTTATGCCGATAGCTTCGCACTGGACCCgg  <  1:3250894/63‑1 (MQ=255) ttCTGGCAAGCCAGGCAGAGAGCGTTTGTGAAGCTTATGCCGATAGCTTCGCACTGGACCCgg  <  1:3075553/63‑1 (MQ=255) ttCTGGCAAGCCAGGCAGAGAGCGTTTGTGAAGCTTATGCCGATAGCTTCGCACTGGACCCgg  <  1:2862947/63‑1 (MQ=255) ttCTGGCAAGCCAGGCAGAGAGCGTTTGTGAAGCTTATGCCGATAGCTTCGCACTGGACCCgg  <  1:2687415/63‑1 (MQ=255) ttCTGGCAAGCCAGGCAGAGAGCGTTTGTGAAGCTTATGCCGATAGCTTCGCACTGGACCCgg  <  1:2553936/63‑1 (MQ=255) ttCTGGCAAGCCAGGCAGAGAGCGTTTGTGAAGCTTATGCCGATAGCTTCGCACTGGACCCgg  <  1:1059728/63‑1 (MQ=255) ttCTGGCAAGCCAGGCAGAGAGCGTTTGTGAAGCTTATGCCGATAGCTTCGCACTGGACCCgg  <  1:2452914/63‑1 (MQ=255) ttCTGGCAAGCCAGGCAGAGAGCGTTTGTGAAGCTTATGCCGATAGCTTCGCACTGGACCCgg  <  1:2423391/63‑1 (MQ=255) ttCTGGCAAGCCAGGCAGAGAGCGTTTGTGAAGCTTATGCCGATAGCTTCGCACTGGACCCgg  <  1:2249282/63‑1 (MQ=255) ttCTGGCAAGCCAGGCAGAGAGCGTTTGTGAAGCTTATGCCGATAGCTTCGCACTGGACCCgg  <  1:2082193/63‑1 (MQ=255) ttCTGGCAAGCCAGGCAGAGAGCGTTTGTGAAGCTTATGCCGATAGCTTCGCACTGGACCCgg  <  1:1610563/63‑1 (MQ=255) ttCTGGCAAGCCAGGCAGAGAGCGTTTGTGAAGCTTATGCCGATAGCTTCGCACTGGACCCgg  <  1:1501537/63‑1 (MQ=255) ttCTGGCAAGCCAGGCAGAGAGCGTTTGTGAAGCTTATGCCGATAGCTTCGCACTGGACCCgg  <  1:1237140/63‑1 (MQ=255) ttCTGGCAAGCCAGGCAGAGAGCGTTTGTGAAGCTTATGCCGATAGCTTCGCACTGGACCCgg  <  1:1143657/63‑1 (MQ=255) ttCTGGCAAGCAAGGCAGAGAGCGTTTGTGAAGCTTATGCCGATAGCTTCGCACTGGACCCgg  <  1:2595341/63‑1 (MQ=255) |                                                               TTCTGGCAAGCCAGGCAGAGAGCGTTTGTGAAGCTTATGCCGATAGCTTCGCACTGGACCCGG  >  minE/2225124‑2225186

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑