Missing coverage evidence...
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TCGGTTCTTCCGGTGGCGTAAAACAGATTATCGCTAATACCGTTGATTTTGGTGCCTCTGACGCGCCGCTG  >  minE/2475050‑2475120 |                                                                       tCGGTTCTTCCGGTGGCGTAAAACAGATTATCGCTAATACCGTTGATTTTGGTGCCTCTGACGCGCCGCTg  <  1:3286067/71‑1 (MQ=255) tCGGTTCTTCCGGTGGCGTAAAACAGATTATCGCTAATACCGTTGATTTTGGTGCCTCTGACGCGCCGCTg  <  1:715520/71‑1 (MQ=255) tCGGTTCTTCCGGTGGCGTAAAACAGATTATCGCTAATACCGTTGATTTTGGTGCCTCTGACGCGCCGCTg  <  1:628275/71‑1 (MQ=255) tCGGTTCTTCCGGTGGCGTAAAACAGATTATCGCTAATACCGTTGATTTTGGTGCCTCTGACGCGCCGCTg  <  1:624073/71‑1 (MQ=255) tCGGTTCTTCCGGTGGCGTAAAACAGATTATCGCTAATACCGTTGATTTTGGTGCCTCTGACGCGCCGCTg  <  1:617067/71‑1 (MQ=255) tCGGTTCTTCCGGTGGCGTAAAACAGATTATCGCTAATACCGTTGATTTTGGTGCCTCTGACGCGCCGCTg  <  1:582478/71‑1 (MQ=255) tCGGTTCTTCCGGTGGCGTAAAACAGATTATCGCTAATACCGTTGATTTTGGTGCCTCTGACGCGCCGCTg  <  1:558409/71‑1 (MQ=255) tCGGTTCTTCCGGTGGCGTAAAACAGATTATCGCTAATACCGTTGATTTTGGTGCCTCTGACGCGCCGCTg  <  1:541695/71‑1 (MQ=255) tCGGTTCTTCCGGTGGCGTAAAACAGATTATCGCTAATACCGTTGATTTTGGTGCCTCTGACGCGCCGCTg  <  1:370545/71‑1 (MQ=255) tCGGTTCTTCCGGTGGCGTAAAACAGATTATCGCTAATACCGTTGATTTTGGTGCCTCTGACGCGCCGCTg  <  1:370542/71‑1 (MQ=255) tCGGTTCTTCCGGTGGCGTAAAACAGATTATCGCTAATACCGTTGATTTTGGTGCCTCTGACGCGCCGCTg  <  1:1134673/71‑1 (MQ=255) tCGGTTCTTCCGGTGGCGTAAAACAGATTATCGCTAATACCGTTGATTTTGGTGCCTCTGACGCGCCGCTg  <  1:325438/71‑1 (MQ=255) tCGGTTCTTCCGGTGGCGTAAAACAGATTATCGCTAATACCGTTGATTTTGGTGCCTCTGACGCGCCGCTg  <  1:2902230/71‑1 (MQ=255) tCGGTTCTTCCGGTGGCGTAAAACAGATTATCGCTAATACCGTTGATTTTGGTGCCTCTGACGCGCCGCTg  <  1:239128/71‑1 (MQ=255) tCGGTTCTTCCGGTGGCGTAAAACAGATTATCGCTAATACCGTTGATTTTGGTGCCTCTGACGCGCCGCTg  <  1:1792069/71‑1 (MQ=255) tCGGTTCTTCCGGTGGCGTAAAACAGATTATCGCTAATACCGTTGATTTTGGTGCCTCTGACGCGCCGCTg  <  1:1782087/71‑1 (MQ=255) tCGGTTCTTCCGGTGGCGTAAAACAGATTATCGCTAATACCGTTGATTTTGGTGCCTCTGACGCGCCGCTg  <  1:1755168/71‑1 (MQ=255) tCGGTTCTTCCGGTGGCGTAAAACAGATTATCGCTAATACCGTTGATTTTGGTGCCTCTGACGCGCCGCTg  <  1:1449832/71‑1 (MQ=255) tCGGTTCTTCCGGTGGCGTAAAACAGATTATCGCTAATACCGTTGATTTTGGTGCCTCTGACGCGCCGCTg  <  1:1418528/71‑1 (MQ=255) |                                                                       TCGGTTCTTCCGGTGGCGTAAAACAGATTATCGCTAATACCGTTGATTTTGGTGCCTCTGACGCGCCGCTG  >  minE/2475050‑2475120

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑