Missing coverage evidence...
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GGATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTA  >  minE/2496662‑2496732 |                                                                       ggATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTa  <  1:2279381/71‑1 (MQ=255) ggATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTa  <  1:891894/71‑1 (MQ=255) ggATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTa  <  1:801849/71‑1 (MQ=255) ggATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTa  <  1:496906/71‑1 (MQ=255) ggATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTa  <  1:489823/71‑1 (MQ=255) ggATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTa  <  1:425782/71‑1 (MQ=255) ggATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTa  <  1:3231164/71‑1 (MQ=255) ggATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTa  <  1:3209139/71‑1 (MQ=255) ggATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTa  <  1:3190025/71‑1 (MQ=255) ggATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTa  <  1:3090480/71‑1 (MQ=255) ggATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTa  <  1:300969/71‑1 (MQ=255) ggATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTa  <  1:2657152/71‑1 (MQ=255) ggATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTa  <  1:2541414/71‑1 (MQ=255) ggATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTa  <  1:2447624/71‑1 (MQ=255) ggATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTa  <  1:1021826/71‑1 (MQ=255) ggATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTa  <  1:2189891/71‑1 (MQ=255) ggATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTa  <  1:2025464/71‑1 (MQ=255) ggATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTa  <  1:1721193/71‑1 (MQ=255) ggATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTa  <  1:169740/71‑1 (MQ=255) ggATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTa  <  1:1677011/71‑1 (MQ=255) ggATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTa  <  1:1480049/71‑1 (MQ=255) ggATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTa  <  1:1428914/71‑1 (MQ=255) ggATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTa  <  1:1428512/71‑1 (MQ=255) ggATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTa  <  1:1347740/71‑1 (MQ=255) ggATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTa  <  1:1264668/71‑1 (MQ=255) ggATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTa  <  1:1181809/71‑1 (MQ=255) ggATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTa  <  1:1039992/71‑1 (MQ=255) ggATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTAAGGAGCACTGCCAGCTGACGTa  <  1:1615851/71‑1 (MQ=255) |                                                                       GGATAAGAATGGCGATATCCACCAGGTTCATACGCGTCTCCTGTGGTTCAGGAGCACTGCCAGCTGACGTA  >  minE/2496662‑2496732

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑