Missing coverage evidence...
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AATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCAGGGTTTGCAGCAGCGTGCCCGCGAGCGC  >  minE/2941170‑2941238 |                                                                     aaTGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTGAGGGTTTGCAGCAGCGTGCCCGCGAgcgc  >  1:1592277/1‑69 (MQ=255) aaTGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCAGGGt                          >  1:554551/1‑45 (MQ=255) aaTGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCAGGGTTTGCAGCAGCGTGCCCGCGAgcgc  >  1:2164238/1‑69 (MQ=255) aaTGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCAGGGTTTGCAGCAGCGTGCCCGCGAgcgc  >  1:911564/1‑69 (MQ=255) aaTGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCAGGGTTTGCAGCAGCGTGCCCGCGAgcgc  >  1:436803/1‑69 (MQ=255) aaTGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCAGGGTTTGCAGCAGCGTGCCCGCGAgcgc  >  1:3199575/1‑69 (MQ=255) aaTGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCAGGGTTTGCAGCAGCGTGCCCGCGAgcgc  >  1:2558824/1‑69 (MQ=255) aaTGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCAGGGTTTGCAGCAGCGTGCCCGCGAgcgc  >  1:2231009/1‑69 (MQ=255) aaTGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCAGGGTTTGCAGCAGCGTGCCCGCGAgcgc  >  1:2222222/1‑69 (MQ=255) aaTGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCAGGGTTTGCAGCAGCGTGCCCGCGAgcgc  >  1:1008924/1‑69 (MQ=255) aaTGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCAGGGTTTGCAGCAGCGTGCCCGCGAgcgc  >  1:2100106/1‑69 (MQ=255) aaTGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCAGGGTTTGCAGCAGCGTGCCCGCGAgcgc  >  1:1823545/1‑69 (MQ=255) aaTGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCAGGGTTTGCAGCAGCGTGCCCGCGAgcgc  >  1:1726443/1‑69 (MQ=255) aaTGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCAGGGTTTGCAGCAGCGTGCCCGCGAgcgc  >  1:1626162/1‑69 (MQ=255) aaTGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCAGGGTTTGCAGCAGCGTGCCCGCGAgcgc  >  1:1608996/1‑69 (MQ=255) aaTGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCAGGGTTTGCAGCAGCGTGCCCGCGAgcgc  >  1:1412926/1‑69 (MQ=255) aaTGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCAGGGTTTGCAGCAGCGTGCCCGCGAgcgc  >  1:1309014/1‑69 (MQ=255) aaTGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCAGGGTTTGCAGCAGCGTGCCCGCGAgcgc  >  1:1215987/1‑69 (MQ=255) aaTGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCAGGGTTTGCAGCAGCGTGCCCGCGAgcgc  >  1:1163333/1‑69 (MQ=255) aaTGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCAGGGTTTGCAGCAGCGTGCCCGCGAgcg   >  1:2790495/1‑68 (MQ=255) aaTGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCAGGGTTTGCAGCAGCGTGCCAGCGAgcgc  >  1:2984019/1‑69 (MQ=255) aaTGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCAGGGTTTGCAGCAGCGTCCCCGCGAgcgc  >  1:3170393/1‑69 (MQ=255) aaTGCCGAACAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCAGGGTTTGCAGCAGCGTGCCCGCGAgcgc  >  1:715950/1‑69 (MQ=255) |                                                                     AATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCAGGGTTTGCAGCAGCGTGCCCGCGAGCGC  >  minE/2941170‑2941238

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑