Missing coverage evidence...
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TGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATG  >  minE/595745‑595815 |                                                                       tGCGTTTAAAGCCGCGCTTGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATg  >  1:2995329/1‑71 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAAc                                      >  1:1392743/1‑35 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACg                                     >  1:1424642/1‑36 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATg                          >  1:675171/1‑47 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCAtt           >  1:3270363/1‑62 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTg         >  1:2723493/1‑64 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAAt   >  1:1288642/1‑70 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAAt   >  1:1641864/1‑70 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAAt   >  1:2718362/1‑70 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAAt   >  1:2332451/1‑70 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAAt   >  1:2028038/1‑70 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAAt   >  1:213172/1‑70 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAAt   >  1:2285038/1‑70 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATg  >  1:3039166/1‑71 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATg  >  1:348644/1‑71 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATg  >  1:3277882/1‑71 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATg  >  1:546021/1‑71 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATg  >  1:2914275/1‑71 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATg  >  1:466908/1‑71 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATg  >  1:473417/1‑71 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATg  >  1:2655538/1‑71 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATg  >  1:678953/1‑71 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATg  >  1:691238/1‑71 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATg  >  1:831900/1‑71 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATg  >  1:889584/1‑71 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATg  >  1:919978/1‑71 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATg  >  1:289310/1‑71 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATg  >  1:275290/1‑71 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATg  >  1:268474/1‑71 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATg  >  1:1041619/1‑71 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATg  >  1:248819/1‑71 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATg  >  1:2375247/1‑71 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATg  >  1:2203733/1‑71 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATg  >  1:2189771/1‑71 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATg  >  1:2146420/1‑71 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATg  >  1:1976020/1‑71 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATg  >  1:1733263/1‑71 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATg  >  1:1617598/1‑71 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATg  >  1:1564639/1‑71 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATg  >  1:1047962/1‑71 (MQ=255) tGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGATCATTTGCGTAATg  >  1:2474889/1‑71 (MQ=255) |                                                                       TGCGTTTAAAGCCGCGCTGGCCGATGCTCGCGAACGCCCGGATTATGACGTGCCGGTTCATTTGCGTAATG  >  minE/595745‑595815

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑