| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | minE | 22,060 | A→T | A664A (GCA→GCT) | ileS → | isoleucyl‑tRNA synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | minE | 22,060 | 0 | A | T | 78.6% | 87.8 / 21.9 | 42 | A664A (GCA→GCT) | ileS | isoleucyl‑tRNA synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/9); new base T (0/33); total (0/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.90e-01 | |||||||||||
GTATCCGTAACACCGCGCGCTTCCTGCTGGCAAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTGG > minE/22029‑22121 | gtATCCGTAACACGGCGCGCTTCCTGCTGGCAAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGaa < 1:805003/70‑1 (MQ=255)gtATCCGTAACACCGCGCGCTTCCTGCTGGCAAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGaa < 1:2442575/70‑1 (MQ=255)gtATCCGTAACACCGCGCGCTTCCTGCTGGCAAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGaa < 1:2245652/70‑1 (MQ=255)gtATCCGTAACACCGCGCGCTTCCTGCTGGCAAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGaa < 1:2199437/70‑1 (MQ=255)gtATCCGTAACACCGCGCGCTTCCTGCTGGCAAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGaa < 1:2108816/70‑1 (MQ=255)gtATCCGTAACACCGCGCGCTTCCTGCTGGCAAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGaa < 1:2929526/70‑1 (MQ=255)gtATCCGTAACACCGCGCGCTTCCTGCTGGCAAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGaa < 1:3284631/70‑1 (MQ=255)gtATCCGTAACACCGCGCGCTTCCTGCTGGCAAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGaa < 1:1721700/70‑1 (MQ=255)gtATCCGTAACACCGCGCGCTTCCTGCTGGCAAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGaa < 1:1083015/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:397213/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:399013/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:465993/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:3236862/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:3219896/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:3012031/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:530287/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:596740/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:2783574/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:2601626/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:602383/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:2558343/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:2500455/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:2274149/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:1808553/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:1065777/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:1123804/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:1136051/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:121953/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:1269197/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:1448660/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:1638300/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:1799519/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:2436449/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:1823402/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:1966910/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:2079559/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:2125407/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:2134686/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:220360/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:1046528/70‑1 (MQ=255) ctgctgGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:2303469/70‑1 (MQ=255) ctgcggGCTAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTgg < 1:434958/70‑1 (MQ=255) | GTATCCGTAACACCGCGCGCTTCCTGCTGGCAAACCTGAACGGTTTTGATCCAGCAAAAGATATGGTGAAACCGGAAGAGATGGTGGTACTGG > minE/22029‑22121 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |