Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	minE	395,496	G→T	D283Y (GAT→TAT)	ahpF →	alkyl hydroperoxide reductase, F52a subunit, FAD/NAD(P)‑binding

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	minE	395,496	0	G	T	100.0%	122.5 / NA	38	D283Y (GAT→TAT)	ahpF	alkyl hydroperoxide reductase, F52a subunit, FAD/NAD(P)‑binding
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base T (0/38);  total (0/38)

CACGTTGATGAATACGACGTTGATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTG  >  minE/395475‑395544                      |                                                 cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:533016/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:2807106/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:2811244/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:3046116/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:3052117/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:3076829/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:3225470/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:324122/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:401993/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:51106/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:1270154/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:553024/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:568546/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:58582/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:662075/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:675740/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:712930/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:829188/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:946657/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:2022062/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:1031025/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:1406601/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:162940/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:1655378/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:1667568/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:1706146/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:1719778/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:1915673/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:1925932/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:2106821/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:2118289/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:2243528/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:2413295/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:2506259/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:251739/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:25791/70‑1 (MQ=255) cACGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:2661893/70‑1 (MQ=255)  aCGTTGATGAATACGACGTTTATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTg  <  1:2721644/69‑1 (MQ=255)                      |                                                 CACGTTGATGAATACGACGTTGATGTGATCGACAGCCAGAGCGCCAGCAAACTGATCCCAGCAGCAGTTG  >  minE/395475‑395544

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑