Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA minE 1,097,909 T→C intergenic (+32/‑397) ydiK → / → ydiL predicted inner membrane protein/conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*minE1,097,9090TC100.0% 149.3 / NA 41intergenic (+32/‑397)ydiK/ydiLpredicted inner membrane protein/conserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (14/27);  total (14/27)

AACCGAATAAGTAATTTCTCATCAGGCGGCTCTGCCGCCTGATTGTTAACCACCGCTAATTGATATTTGCTTGCTCTTCCCCATATTTTCCTGCTTACCGCCATT  >  minE/1097864‑1097968
                                             |                                                           
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aaCCGAATAAGTAATTTCTCATCAGGCGGCTCTGCCGCCTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATttgct                                    <  1:2803393/71‑1 (MQ=255)
aaCCGAATAAGTAATTTCTCATCAGGCGGCTCTGCCGCCTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATttgct                                    <  1:1470249/71‑1 (MQ=255)
aaCCGAATAAGTAATTTCTCATCAGGCGGCTCTGCCGCCTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATttgct                                    <  1:1773721/71‑1 (MQ=255)
aaCCGAATAAGTAATTTCTCATCAGGCGGCTCTGCCGCCTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATttgct                                    <  1:2031469/71‑1 (MQ=255)
aaCCGAATAAGTAATTTCTCATCAGGCGGCTCTGCCGCCTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATttgct                                    <  1:3075536/71‑1 (MQ=255)
aaCCGAATAAGTAATTTCTCATCAGGCGGCTCTGCCGCCTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATttgct                                    <  1:2807088/71‑1 (MQ=255)
 aCCGAATAAGTAATTTCTCATCAGGCGGCTCTGCCGCCTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATttgctt                                   <  1:2443106/71‑1 (MQ=255)
 aCCGAATAAGTAATTTCTCATCAGGCGGCTCTGCCGCCTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATttgctt                                   <  1:951100/71‑1 (MQ=255)
 aCCGAATAAGTAATTTCTCATCAGGCGGCTCTGCCGCCTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATttgctt                                   <  1:2546639/71‑1 (MQ=255)
 aCCGAATAAGTAATTTCTCATCAGGCGGCTCTGCCGCCTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATttgctt                                   <  1:281904/71‑1 (MQ=255)
 aCCGAATAAGTAATTTCTCATCAGGCGGCTCTGCCGCCTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATttgctt                                   <  1:2876346/71‑1 (MQ=255)
 aCCGAATAAGTAATTTCTCATCAGGCGGCTCTGCCGCCTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATttgctt                                   <  1:372050/71‑1 (MQ=255)
 aCCGAATAAGTAATTTCTCATCAGGCGGCTCTGCCGCCTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATttgctt                                   <  1:463225/71‑1 (MQ=255)
 aCCGAATAAGTAATTTCTCATCAGGCGGCTCTGCCGCCTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATttgctt                                   <  1:58603/71‑1 (MQ=255)
 aCCGAATAAGTAATTTCTCATCAGGCGGCTCTGCCGCCTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATttgctt                                   <  1:808054/71‑1 (MQ=255)
 aCCGAATAAGTAATTTCTCATCAGGCGGCTCTGCCGCCTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATttgctt                                   <  1:842407/71‑1 (MQ=255)
 aCCGAATAAGTAATTTCTCATCAGGCGGCTCTGCCGCCTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATttgctt                                   <  1:2289558/71‑1 (MQ=255)
 aCCGAATAAGTAATTTCTCATCAGGCGGCTCTGCCGCCTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATttgctt                                   <  1:2269691/71‑1 (MQ=255)
 aCCGAATAAGTAATTTCTCATCAGGCGGCTCTGCCGCCTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATttgctt                                   <  1:2001498/71‑1 (MQ=255)
 aCCGAATAAGTAATTTCTCATCAGGCGGCTCTGCCGCCTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATttgctt                                   <  1:2347591/71‑1 (MQ=255)
  ccGAATAAGTAATTTCTCATCAGGCGGCTCTGCCGCCTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATttgctt                                   <  1:775956/70‑1 (MQ=255)
        aaGTAATTTCTCATCAGGCGGCTCTGCCGCCTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATttgctt                                   <  1:1796372/64‑1 (MQ=255)
           tAATTTCTCATCAGGCGGCTCTGCCGCCTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATTTGCTTGCTCTTccc                          >  1:3095217/1‑70 (MQ=255)
           tAATTTCTCATCAGGCGGCTCTGCCGCCTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATTTGCTTGCTCTTccc                          >  1:1444958/1‑70 (MQ=255)
                    atcaGGCGGCTCTGCCGCCTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATTTGCTTGCTCTTCCCCATATTTTc                 <  1:1468101/70‑1 (MQ=255)
                    atcaGGCGGCTCTGCCGCCTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATTTGCTTGCTCTTCCCCATATTTTc                 <  1:1157291/70‑1 (MQ=255)
                           ggcTCTGCCGCCTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATttgct                                    <  1:2054929/44‑1 (MQ=255)
                                 gccgccTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATTTGCTTGCTCTTCCCCATATTTTCCTGCTTACCGCCAt   >  1:1885812/1‑71 (MQ=255)
                                 gccgccTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATTTGCTTGCTCTTCCCCATATTTTCCTGCTTACCGCCAt   >  1:1855183/1‑71 (MQ=255)
                                 gccgccTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATTTGCTTGCTCTTCCCCATATTTTCCTGCTTACCGCCAt   >  1:2858057/1‑71 (MQ=255)
                                 gccgccTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATTTGCTTGCTCTTCCCCATATTTTCCTGCTTACCGCCAt   >  1:349421/1‑71 (MQ=255)
                                 gccgccTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATTTGCTTGCTCTTCCCCATATTTTCCTGCTTACCGCCAt   >  1:1922111/1‑71 (MQ=255)
                                 gccgccTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATTTGCTTGCTCTTCCCCATATTTTCCTGCTTACCGCCAt   >  1:2711015/1‑71 (MQ=255)
                                 gccgccTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATTTGCTTGCTCTTCCCCATATTTTCCTGCTTACCGCCAt   >  1:1420070/1‑71 (MQ=255)
                                 gccgccTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATTTGCTTGCTCTTCCCCATATTTTCCTGCTTACCGCCAt   >  1:919421/1‑71 (MQ=255)
                                 gccgccTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATTTGCTTGCTCTTCCCCATATTTTCCTGCTTACCGCCAt   >  1:1095219/1‑71 (MQ=255)
                                  ccgccTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATTTGCTTGCTCTTCCCCATATTTTCCTGCTTACCGCCAtt  >  1:3022243/1‑71 (MQ=255)
                                  ccgccTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATTTGCTTGCTCTTCCCCATATTTTCCTGCTTACCGCCAtt  >  1:683529/1‑71 (MQ=255)
                                  ccgccTGATTGCTAACCACCGCTAATTGATATTTGCTTGCTCTTCCCCATATTTTCCTGCTTACCGCCAtt  >  1:1234941/1‑71 (MQ=255)
                                             |                                                           
AACCGAATAAGTAATTTCTCATCAGGCGGCTCTGCCGCCTGATTGTTAACCACCGCTAATTGATATTTGCTTGCTCTTCCCCATATTTTCCTGCTTACCGCCATT  >  minE/1097864‑1097968

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: