Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA minE 1,099,149 A→G T130A (ACA→GCA)  ydiM → predicted transporter

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*minE1,099,1490AG100.0% 244.5 / NA 65T130A (ACA→GCA) ydiMpredicted transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (0/65);  total (0/65)

AACAGTTTTCTCGATGCAGGCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGACAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGACAATT  >  minE/1099086‑1099192
                                                               |                                           
aaCAGTTTTCTCGATGCAGGCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCaa                                      <  1:766450/71‑1 (MQ=255)
aaCAGTTTTCTCGATGCAGGCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCaa                                      <  1:2409637/71‑1 (MQ=255)
aaCAGTTTTCTCGATGCAGGCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCaa                                      <  1:3148644/71‑1 (MQ=255)
   aGTTTTCTCGATGCAGGCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAatat                                   <  1:1181181/71‑1 (MQ=255)
   aGTTTTCTCGATGCAGGCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAatat                                   <  1:97892/71‑1 (MQ=255)
   aGTTTTCTCGATGCAGGCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAatat                                   <  1:3141423/71‑1 (MQ=255)
   aGTTTTCTCGATGCAGGCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAatat                                   <  1:1594321/71‑1 (MQ=255)
   aGTTTTCTCGATGCAGGCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAatat                                   <  1:2659794/71‑1 (MQ=255)
   aGTTTTCTCGATGCAGGCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAatat                                   <  1:2615170/71‑1 (MQ=255)
   aGTTTTCTCGATGCAGGCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAatat                                   <  1:2611138/71‑1 (MQ=255)
            gATGCAGGCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTttaattaa                          <  1:2363135/71‑1 (MQ=255)
            gATGCAGGCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTttaattaa                          <  1:1212299/71‑1 (MQ=255)
            gATGCAGGCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTttaattaa                          <  1:246220/71‑1 (MQ=255)
            gATGCAGGCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTttaattaa                          <  1:2489099/71‑1 (MQ=255)
            gATGCAGGCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTttaattaa                          <  1:2727883/71‑1 (MQ=255)
            gATGCAGGCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTttaattaa                          <  1:2810337/71‑1 (MQ=255)
            gATGCAGGCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTttaattaa                          <  1:3269292/71‑1 (MQ=255)
            gATGCAGGCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTttaattaa                          <  1:684729/71‑1 (MQ=255)
                   gCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTaaa                         <  1:839470/65‑1 (MQ=255)
                   gCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTaaa                         <  1:3244136/65‑1 (MQ=255)
                   gCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTaaa                         <  1:2321905/65‑1 (MQ=255)
                   gCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTaaa                         <  1:1420700/65‑1 (MQ=255)
                   gCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTaaa                         <  1:344402/65‑1 (MQ=255)
                   gCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTaaa                         <  1:381740/65‑1 (MQ=255)
                   gCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTaaa                         <  1:495306/65‑1 (MQ=255)
                   gCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTaaa                         <  1:1857107/65‑1 (MQ=255)
                   gCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTaaa                         <  1:1926844/65‑1 (MQ=255)
                   gCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTaaa                         <  1:2211653/65‑1 (MQ=255)
                   gCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTaaa                         <  1:781575/65‑1 (MQ=255)
                   gCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTaaa                         <  1:97579/65‑1 (MQ=255)
                   gCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTaaa                         <  1:95704/65‑1 (MQ=255)
                                tttGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGAc      <  1:322596/71‑1 (MQ=255)
                                tttGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGAc      <  1:1318403/71‑1 (MQ=255)
                                tttGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGAc      <  1:780804/71‑1 (MQ=255)
                                tttGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGAc      <  1:2836138/71‑1 (MQ=255)
                                tttGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGAc      <  1:2868468/71‑1 (MQ=255)
                                tttGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGAc      <  1:1264931/71‑1 (MQ=255)
                                tttGATGGAAGCTTTTACACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGAc      <  1:2866435/71‑1 (MQ=255)
                                  tGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGAc      <  1:642473/69‑1 (MQ=255)
                                    aTGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGACAAtt  <  1:884977/71‑1 (MQ=255)
                                    aTGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGACAAtt  <  1:425765/71‑1 (MQ=255)
                                    aTGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGACAAtt  <  1:832511/71‑1 (MQ=255)
                                    aTGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGACAAtt  <  1:528421/71‑1 (MQ=255)
                                    aTGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGACAAtt  <  1:610295/71‑1 (MQ=255)
                                    aTGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGACAAtt  <  1:150498/71‑1 (MQ=255)
                                    aTGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGACAAtt  <  1:1516307/71‑1 (MQ=255)
                                    aTGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGACAAtt  <  1:2924184/71‑1 (MQ=255)
                                    aTGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGACAAtt  <  1:2751575/71‑1 (MQ=255)
                                    aTGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGACAAtt  <  1:2734679/71‑1 (MQ=255)
                                    aTGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGACAAtt  <  1:1733442/71‑1 (MQ=255)
                                    aTGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGACAAtt  <  1:2564123/71‑1 (MQ=255)
                                    aTGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGACAAtt  <  1:2552308/71‑1 (MQ=255)
                                    aTGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGACAAtt  <  1:248982/71‑1 (MQ=255)
                                    aTGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGACAAtt  <  1:2447232/71‑1 (MQ=255)
                                    aTGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGACAAt   <  1:3118452/70‑1 (MQ=255)
                                    aTGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGACAAt   <  1:1726785/70‑1 (MQ=255)
                                    aTGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGACAAt   <  1:2798679/70‑1 (MQ=255)
                                    aTGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGACAAt   <  1:2154999/70‑1 (MQ=255)
                                    aTGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGCACAAtt  <  1:420110/71‑1 (MQ=255)
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                                        aaGCTTTTCCACGCTCACCTGGGGCAGCCAATATTTTAATTaaa                         <  1:2099926/44‑1 (MQ=255)
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                                                          cTGGGGCAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGACAAt   <  1:508237/48‑1 (MQ=255)
                                                               |                                           
AACAGTTTTCTCGATGCAGGCACTTATCCCAGTTTGATGGAAGCTTTTCCACGCTCACCTGGGACAGCCAATATTTTAATTAAAGCATTTGTTTCCAGCGGACAATT  >  minE/1099086‑1099192

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: