| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 204740 | NA (NA) | 14 (0.190) | 8/110 | 4.3 | NA | noncoding (157/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA |
| ? | minE | = 204751 | NA (NA) | noncoding (168/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > minE/204663‑204740‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcattaacCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTATAA < minE/204751‑204682 GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:1496899/71‑1GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:1248290/71‑1GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:3963611/71‑1 GTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATC < 1:2961124/71‑1 GTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATC < 1:219073/71‑1 GTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATC < 1:1073815/71‑1 GTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:2193763/70‑1 GTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT > 1:2269746/1‑70 AAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:385607/1‑71 AAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:3846446/1‑71 AAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:1423142/1‑71 AAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:3789079/1‑71 AAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:3458794/1‑71 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:2274498/71‑1 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:2395614/71‑1 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:2018652/71‑1 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:1692369/71‑1 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:3154796/71‑1 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:3172063/71‑1 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:2658997/1‑70 GGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA < 1:4149331/71‑1 GGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA < 1:2326787/71‑1 GTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA < 1:3393458/71‑1 GTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA < 1:213431/70‑1 TGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC > 1:1044822/1‑71 TGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:1728691/63‑1 CGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA > 1:318818/1‑60 CGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA > 1:321195/1‑60 CGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA > 1:1346636/1‑56 GTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:758711/53‑1 TTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA < 1:1758152/57‑1 TTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA > 1:1105278/1‑57 ATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA > 1:3122676/1‑56 TAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTTA < 1:2260707/71‑1 CGGCGTTTTCCGAATTGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGA < 1:853674/71‑1 CGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTTAA < 1:3730034/68‑1 TTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:1262691/39‑1 TTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA < 1:1837865/40‑1 GGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTTAAT < 1:4004181/53‑1 GAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTTAAT > 1:1975435/1‑51 GAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTT < 1:3427060/48‑1 GAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTT < 1:3878212/48‑1 AGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTT < 1:3346369/41‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:2411273/1‑71 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:3753303/1‑71 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:3262359/1‑71 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:3938948/1‑71 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:645121/1‑71 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:4045195/1‑71 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGA < 1:1017222/63‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACA > 1:3555698/1‑44 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC < 1:3666862/43‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:3985164/1‑40 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:2822895/1‑40 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGA < 1:208060/38‑1 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG > 1:615214/1‑71 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG > 1:2766619/1‑71 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG > 1:818726/1‑71 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:2370660/1‑70 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGC < 1:147097/68‑1 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGC < 1:3514096/68‑1 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCAATTCGGAAATCGCCGG > 1:4029682/1‑71 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:704319/1‑39 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGA < 1:2813679/37‑1 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:914851/1‑71 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:1782313/1‑71 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:2897556/1‑71 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:2525302/1‑71 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:2706026/1‑71 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG < 1:324003/70‑1 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG < 1:1364981/70‑1 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG < 1:559928/70‑1 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG < 1:2745416/69‑1 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGC < 1:1201257/67‑1 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAA < 1:580748/63‑1 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCAT < 1:1814340/56‑1 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGA > 1:3612752/1‑36 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGA < 1:2682766/36‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:3050718/1‑70 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:3045791/1‑70 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:1666813/1‑70 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG < 1:4136416/69‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATC > 1:2335156/1‑64 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:3360657/39‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:2586301/39‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGA < 1:2350867/35‑1 tagCCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTA > 1:1774260/4‑71 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTA > 1:3491185/1‑71 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTA > 1:533897/1‑71 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCC > 1:634260/1‑51 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC > 1:1183908/1‑37 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:2554271/1‑36 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAAT > 1:2046252/1‑61 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA > 1:1549855/1‑37 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:2072299/1‑35 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:1239195/1‑35 ACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTATA < 1:3566245/71‑1 ACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTATA < 1:2478066/71‑1 ACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTAT < 1:1216628/70‑1 CCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTATAA > 1:4120635/1‑71 GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > minE/204663‑204740‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcattaacCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTATAA < minE/204751‑204682 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |