Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 313587 313606 20 59 [0] [0] 81 acrA multidrug efflux system

CACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATCC  >  minE/313522‑313586
                                                                |
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:669898/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:1009152/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:275248/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:278000/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:328704/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:335336/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:393271/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:404261/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:460902/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:486773/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:527531/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:544688/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:557711/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:568754/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:644571/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:238928/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:709944/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:726438/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:76186/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:776735/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:783118/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:81285/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:880424/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:903166/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:911953/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:924353/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:931867/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:932276/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:972818/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:1419772/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:1029309/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:1066634/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:1125620/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:1143030/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:1188032/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:1231459/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:1300504/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:1306980/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:1330485/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:1334116/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:133494/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:1376978/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:1390600/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:1393843/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:232008/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:1444568/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:1483224/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:1498455/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:1511042/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:1515991/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:1540002/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:154859/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:1552129/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:164309/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:17876/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:183661/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:184117/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCAAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:382074/1‑65 (MQ=255)
cACGTTCGACTTACAAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATcc  >  1:486768/1‑65 (MQ=255)
                                                                |
CACGTTCGACTTACCAATGCGACCGCTAATCGGAGAGGTGACTTTGGTGTAAGCCAGATTGATCC  >  minE/313522‑313586

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: