Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	361511	361561	51	72 [0]	[0] 14	sfmH	predicted fimbrial‑like adhesin protein

CATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAATA  >  minE/361440‑361510                                                                       | cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAATTAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:1340736/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:352495/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:581159/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:574567/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:549967/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:509251/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:487940/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:438861/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:415707/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:18191/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:345526/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:320366/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:312610/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:303322/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:259714/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:255888/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:1026751/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:194795/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:636621/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:697585/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:755101/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:755520/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:785083/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:810211/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:814261/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:815489/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:820893/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:85642/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:86698/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:907408/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:914553/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:974614/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:987121/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:999411/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:17172/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:1033128/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:1038933/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:1054121/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:1069346/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:1123229/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:119139/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:1192630/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:1207049/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:1258621/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:126793/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:129931/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:1315464/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:1322159/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:132725/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:1350312/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:1467711/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:175367/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:171612/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:164122/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:1479751/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:1383348/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:1463291/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:1449715/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:1418182/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:1406383/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:1400616/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:1396851/71‑1 (MQ=255) cATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:1392998/71‑1 (MQ=255) cATATCCTCGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:1064813/71‑1 (MQ=255)  atatCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:605485/70‑1 (MQ=255)  atatCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:235917/70‑1 (MQ=255)  atatCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGCACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:760775/70‑1 (MQ=255)      ccTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:1509263/66‑1 (MQ=255)          ggCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:1358666/62‑1 (MQ=255)              aCTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:306073/58‑1 (MQ=255)                           aTAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:1104965/45‑1 (MQ=255)                              gTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAata  <  1:862215/42‑1 (MQ=255)                                                                       | CATATCCTGGGCTACTGTTTGTGCAAATAGTACTGGCGTAGCAGAAGATGAACACTATGATCTCTCAAATA  >  minE/361440‑361510

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑