Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 362031 362137 107 124 [0] [0] 122 sfmH predicted fimbrial‑like adhesin protein

Only 100 of 124 total aligned reads displayed.

CGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCGG  >  minE/361960‑362030
                                                                      |
cGGGTTGAAGTACCGCAAACCTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1117915/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:449556/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:600567/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:590338/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:568262/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:567888/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:55518/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:531472/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:522463/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:50235/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:496554/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:468875/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:461011/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:459132/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:653219/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:438833/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:419877/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:417677/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:337490/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:318116/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:31081/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:285995/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:272046/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:261789/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:260515/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:25919/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:797910/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:994386/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:980609/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:971210/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:970653/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:935381/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:917795/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:917607/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:906785/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:886308/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:864672/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:858411/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:829864/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:625693/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:792210/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:778569/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:762072/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:757220/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:715246/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:705863/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:699467/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:662657/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:661260/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:65843/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:253714/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1242392/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1342996/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1322499/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1319960/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1308548/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1303499/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1298880/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:129544/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:129312/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1292030/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1259571/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1249171/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1347619/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1225854/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1211223/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1201821/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1163981/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1130031/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1129103/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1120105/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1079758/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1069071/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1062332/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1052445/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1362678/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:229524/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:227616/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:224152/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:219283/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:156166/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1541651/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1534417/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:152074/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1503515/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1499398/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1483376/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1475670/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1473832/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1457482/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1448545/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1421163/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1400198/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1395708/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1390232/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1388225/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1379463/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1042843/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGAGTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1459239/1‑71 (MQ=255)
cGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGAGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCgg  >  1:1243096/1‑71 (MQ=255)
                                                                      |
CGGGTTGAAGTACCGCAAAACTGCGAATTAAATGCCGGGCAGATTGTTGAATTTGATTTTGGTGATATCGG  >  minE/361960‑362030

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑