Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 362208 362209 2 116 [0] [0] 170 sfmH predicted fimbrial‑like adhesin protein

Only 100 of 116 total aligned reads displayed.

TAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTT  >  minE/362138‑362207
                                                                     |
tAACATTGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTGAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:425030/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:501565/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:632015/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:622118/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:620128/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:615256/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:608348/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:577583/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:570214/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:531314/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:525159/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:509931/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:508300/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:503407/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:648965/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:459623/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:456866/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:436837/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:403751/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:398722/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:397006/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:395519/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:388104/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:387328/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:1014161/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:845405/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:987549/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:97836/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:97740/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:975232/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:966337/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:963592/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:926861/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:919316/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:909359/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:891073/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:849497/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:386545/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:845386/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:830498/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:826822/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:816749/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:762366/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:754410/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:700361/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:699774/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:69361/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:69078/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:682125/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:1200503/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:374718/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:1429729/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:1420987/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:1408850/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:1344842/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:1339042/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:1316874/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:1296860/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:1272696/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:1253677/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:1224139/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:1221572/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:1446366/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:1187971/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:1163634/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:1145333/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:1143719/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:1105015/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:1068100/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:1049741/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:1044862/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:102090/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:1016133/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:1015813/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:238496/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:374028/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:357602/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:354570/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:333899/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:333156/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:311131/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:298947/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:265012/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:249552/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:244014/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:1496430/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:230353/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:225967/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:203479/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:177653/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:173874/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:169162/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:1555239/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:1554590/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:1526134/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:1501535/1‑70 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGCGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:8877/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCACGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:154826/70‑1 (MQ=255)
tAACAATGCATCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  >  1:899654/1‑70 (MQ=255)
       gCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCAGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGttt  <  1:154845/63‑1 (MQ=255)
                                                                     |
TAACAATGCGTCTGGAAGCCAGTGCCGTTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTT  >  minE/362138‑362207

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑