Missing coverage evidence...
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AAAAAGGTGGCCCGCTGGCAGACGGTATCGTGATTACACCGTCCCAT  >  minE/437253‑437299                                               | aaaaaGGTGGCCCGCTGGCAGACGGTATCGTGATTACACCGTCCCAt  >  1:243136/1‑47 (MQ=255) aaaaaGGTGGCCCGCTGGCAGACGGTATCGTGATTACACCGTCCCAt  >  1:967322/1‑47 (MQ=255) aaaaaGGTGGCCCGCTGGCAGACGGTATCGTGATTACACCGTCCCAt  >  1:923614/1‑47 (MQ=255) aaaaaGGTGGCCCGCTGGCAGACGGTATCGTGATTACACCGTCCCAt  >  1:872136/1‑47 (MQ=255) aaaaaGGTGGCCCGCTGGCAGACGGTATCGTGATTACACCGTCCCAt  >  1:771337/1‑47 (MQ=255) aaaaaGGTGGCCCGCTGGCAGACGGTATCGTGATTACACCGTCCCAt  >  1:542245/1‑47 (MQ=255) aaaaaGGTGGCCCGCTGGCAGACGGTATCGTGATTACACCGTCCCAt  >  1:50808/1‑47 (MQ=255) aaaaaGGTGGCCCGCTGGCAGACGGTATCGTGATTACACCGTCCCAt  >  1:444367/1‑47 (MQ=255) aaaaaGGTGGCCCGCTGGCAGACGGTATCGTGATTACACCGTCCCAt  >  1:371614/1‑47 (MQ=255) aaaaaGGTGGCCCGCTGGCAGACGGTATCGTGATTACACCGTCCCAt  >  1:1114132/1‑47 (MQ=255) aaaaaGGTGGCCCGCTGGCAGACGGTATCGTGATTACACCGTCCCAt  >  1:180637/1‑47 (MQ=255) aaaaaGGTGGCCCGCTGGCAGACGGTATCGTGATTACACCGTCCCAt  >  1:178598/1‑47 (MQ=255) aaaaaGGTGGCCCGCTGGCAGACGGTATCGTGATTACACCGTCCCAt  >  1:1389555/1‑47 (MQ=255) aaaaaGGTGGCCCGCTGGCAGACGGTATCGTGATTACACCGTCCCAt  >  1:1298598/1‑47 (MQ=255) aaaaaGGTGGCCCGCTGGCAGACGGTATCGTGATTACACCGTCCCAt  >  1:1292638/1‑47 (MQ=255) aaaaaGGTGGCCCGCTGGCAGACGGTATCGTGATTACACCGTCCCAt  >  1:1158895/1‑47 (MQ=255) aaaaaGGTGGCCCGCTGGCAGACGGTATCGTGATTACACCGTCCCAt  >  1:1133483/1‑47 (MQ=255)                                               | AAAAAGGTGGCCCGCTGGCAGACGGTATCGTGATTACACCGTCCCAT  >  minE/437253‑437299

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑