Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	478197	478518	322	57 [0]	[0] 57	cydA	cytochrome d terminal oxidase, subunit I

CTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGCGCC  >  minE/478148‑478196                                                 | cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGtgcc  <  1:351739/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:611106/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:305919/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:320119/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:335857/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:363904/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:365305/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:36744/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:416150/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:431361/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:448690/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:47016/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:529235/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:592480/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:215286/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:679945/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:691811/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:725207/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:732724/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:765765/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:804539/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:806448/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:810930/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:831131/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:876997/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:885995/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:936376/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:984604/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:1321509/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:1040470/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:1082766/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:1091750/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:1095161/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:1099589/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:112822/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:1158557/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:1159712/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:116007/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:1188506/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:1222915/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:1258428/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:1272191/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:1281576/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:1021660/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:1367499/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:1370763/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:1403650/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:1405171/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:1460484/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:1484104/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:1485226/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:1486630/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:1495102/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:154082/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:190222/49‑1 (MQ=255) cTAACTGGTCTTACTACTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:21534/49‑1 (MQ=255)   aaCTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGTGGATATCTTCGGTGcgcc  <  1:1506228/47‑1 (MQ=255)                                                 | CTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGCGCC  >  minE/478148‑478196

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑